基因页:艾达
Summary?
基因ID | 100 |
Symbol | 艾达 |
同义词 | - |
描述 | adenosine deaminase |
参考 | MIM:608958|HGNC:HGNC:186|Ensembl:ENSG00000196839|HPRD:00038|Vega:Otthumg00000033081 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.12 |
Pascal P值 | 0.767 |
Sherlock P值 | 0.559 |
胎儿β | -0.533 |
主持人 | 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1565076 | CHR2 | 187985321 | 艾达 | 100 | 0.14 | 反式 | ||
RS16971299 | CHR15 | 80032162 | 艾达 | 100 | 0.14 | 反式 | ||
RS16971302 | CHR15 | 80032326 | 艾达 | 100 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA0090 | 0.95 | 0.96 |
KPNA6 | 0.95 | 0.96 |
GPR107 | 0.94 | 0.95 |
SMCR8 | 0.94 | 0.95 |
fto | 0.94 | 0.95 |
ube4a | 0.94 | 0.95 |
SMG7 | 0.93 | 0.94 |
GAPVD1 | 0.93 | 0.93 |
EIF2AK4 | 0.93 | 0.94 |
PDE12 | 0.93 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.73 | -0.79 |
AF347015.31 | -0.73 | -0.76 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.75 |
FXYD1 | -0.71 | -0.72 |
higd1b | -0.70 | -0.75 |
AF347015.8 | -0.69 | -0.73 |
C1orf54 | -0.68 | -0.79 |
ifi27 | -0.67 | -0.70 |
mt-cyb | -0.67 | -0.70 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004000 | 腺苷脱氨酶活性 | EXP | 3182793 | |
去:0004000 | 腺苷脱氨酶活性 | 艾达 | 3182793|8452534|9361033 |11999881|16670267 |
|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 7594462|14684150 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 小鬼 | 7599635 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001666 | 对缺氧的反应 | 艾达 | 16670267 | |
去:0006154 | adenosine catabolic process | 艾达 | 16670267 | |
去:0009168 | 嘌呤核糖核苷单磷酸生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
GO:0042110 | T细胞激活 | 艾达 | 7594462 | |
GO:0032261 | 嘌呤核苷酸拯救 | 小鬼 | 9361033 | |
GO:0033632 | regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin | 艾达 | 11772392 | |
GO:0046103 | 肌苷生物合成过程 | 艾达 | 8894685 | |
GO:0060169 | negative regulation of adenosine receptor signaling pathway | 艾达 | 16670267 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | EXP | 3182793 | |
去:0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
去:0005764 | 溶酶体 | 艾达 | 8452534 | |
GO:0016020 | 膜 | 艾达 | 11999881 | |
去:0009897 | 质膜的外侧 | 艾达 | 7759315|16670267 |