基因页面:NR2E3
总结吗?
| GeneID | 10002年 |
| 象征 | NR2E3 |
| 同义词 | ESCS |内线| RNR | RP37 | rd7 |
| 描述 | 核受体亚科2 3 E组的成员 |
| 参考 | MIM: 604485|HGNC: HGNC: 7974|运用:ENSG00000278570|HPRD: 05132|织女:OTTHUMG00000172841 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 15 q23处 |
| 帕斯卡假定值 | 0.027 |
| 这样假定值 | 7.19的军医 |
| 胎儿β | -0.426 |
| eGene | 小脑半球 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NR2E3 | chr15 | 72104389 . . 72104389 | TCCCCCGG | T | NM_014249 NM_016346 |
。 。 |
移码的 移码的 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10994209 | chr10 | 61877705 | NR2E3 | 10002年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MCM3AP | 0.93 | 0.93 |
| AGPAT6 | 0.93 | 0.95 |
| INTS3 | 0.93 | 0.95 |
| PCGF3 | 0.93 | 0.94 |
| FBXW2 | 0.93 | 0.94 |
| ZNF263 | 0.93 | 0.95 |
| RNPS1 | 0.93 | 0.94 |
| PRPF40B | 0.93 | 0.93 |
| NFX1 | 0.93 | 0.94 |
| IKBKAP | 0.93 | 0.94 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.87 | -0.91 |
| MT-CO2 | -0.85 | -0.91 |
| AF347015.27 | -0.85 | -0.90 |
| AF347015.33 | -0.83 | -0.87 |
| AF347015.8 | -0.82 | -0.90 |
| MT-CYB | -0.82 | -0.87 |
| AF347015.21 | -0.81 | -0.93 |
| FXYD1 | -0.80 | -0.86 |
| HIGD1B | -0.80 | -0.88 |
| AF347015.15 | -0.79 | -0.86 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME核受体转录途径 | 49 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由MYC SCHLOSSER血清反应增强 | 108年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC目标了 | 126年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC的目标 | 212年 | 121年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |