基因页:naalad2
概括?
基因 | 10003 |
象征 | naalad2 |
同义词 | gcpiii | gpciii | naadalase2 | naaladase2 |
描述 | N-乙酰化α连锁的酸性二肽酶2 |
参考 | MIM:611636|HGNC:HGNC:14526|Ensembl:ENSG00000077616|HPRD:07494|Vega:Otthumg00000166368 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11 Q14.3 |
Pascal P值 | 0.042 |
Sherlock P值 | 0.929 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6876210 | CHR5 | 178961709 | naalad2 | 10003 | 0.1 | 反式 | ||
RS4810210 | CHR20 | 59454298 | naalad2 | 10003 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NAALAD2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1QB | 0.72 | 0.70 |
C1QA | 0.70 | 0.68 |
C1QC | 0.69 | 0.64 |
RNASE6 | 0.67 | 0.59 |
SLC2A5 | 0.66 | 0.61 |
暴利 | 0.63 | 0.63 |
HCLS1 | 0.63 | 0.59 |
adora3 | 0.62 | 0.56 |
fcer1g | 0.61 | 0.59 |
GPSM3 | 0.60 | 0.52 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UPF3B | -0.39 | -0.46 |
thoc2 | -0.39 | -0.42 |
murc | -0.37 | -0.34 |
ZNF326 | -0.37 | -0.40 |
HNRNPA2B1 | -0.37 | -0.38 |
ZNF300 | -0.37 | -0.31 |
KIAA1949 | -0.37 | -0.30 |
FNBP1L | -0.37 | -0.30 |
RTF1 | -0.37 | -0.40 |
ZNF669 | -0.37 | -0.33 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008236 | 丝氨酸型肽酶活性 | nas | 谷氨酸(GO期限:6) | 10085079 |
去:0004180 | 羧肽酶活性 | nas | 10085079 | |
GO:0016805 | 二肽酶活性 | nas | 10085079 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008239 | 二肽基肽酶活性 | nas | 10085079 | |
去:0008237 | 金属肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042135 | 神经递质分解代谢过程 | IEA | 神经元,轴突,突触,神经递质(GO术语级别:9) | - |
去:0006508 | 蛋白水解 | nas | 10085079 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | 10085079 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |