基因页:SRA1
概括?
基因 | 10011 |
象征 | SRA1 |
同义词 | sra | srap | straa1 | pp7684 |
描述 | 类固醇受体RNA激活剂1 |
参考 | MIM:603819|HGNC:HGNC:11281|ENSEMBL:ENSG00000213523|HPRD:18716|Vega:Otthumg00000163569 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q31.3 |
Pascal P值 | 4.185E-4 |
胎儿β | -0.639 |
主持人 | 皮质 额叶皮质BA9 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SRA1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Telo2 | 0.74 | 0.76 |
PCNXL3 | 0.73 | 0.74 |
MAPK1IP1L | 0.73 | 0.73 |
SMPD4 | 0.73 | 0.74 |
ZC3HAV1L | 0.73 | 0.73 |
威兹 | 0.72 | 0.78 |
FZR1 | 0.72 | 0.78 |
Cul7 | 0.72 | 0.75 |
arvcf | 0.72 | 0.76 |
ZNF598 | 0.72 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.59 | -0.70 |
MT-CO2 | -0.59 | -0.72 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.72 |
mt-cyb | -0.58 | -0.71 |
AF347015.33 | -0.58 | -0.71 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.72 |
C5orf53 | -0.56 | -0.63 |
AF347015.21 | -0.55 | -0.75 |
AF347015.2 | -0.54 | -0.70 |
AF347015.15 | -0.54 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | ISS | - | |
去:0030374 | 配体依赖性核受体转录共激活因子活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0008283 | 细胞增殖 | 艾达 | 14517287 | |
去:0006915 | 凋亡 | 艾达 | 14517287 | |
去:0030154 | 细胞分化 | 艾达 | 14517287 | |
GO:0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 12565891 | |
去:0005667 | 转录因子复合物 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0030529 | 核糖核蛋白复合物 | IPI | 10199399 | |
GO:0031252 | 细胞前缘 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta Carm er途径 | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta PPARA途径 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID时代基因组途径 | 65 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王攀登目标DN | 186 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |