基因页：HDAC6
概括？
| 基因 | 10013 |
| 象征 | HDAC6 |
| 同义词 | CPBHM | HD6 | JM21 | PPP1R90 |
| 描述 | 组蛋白脱乙酰基酶6 |
| 参考 | MIM：300272|HGNC：HGNC：14064|Ensembl：ENSG0000000094631|HPRD：02228|Vega：Otthumg0000000034496 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XP11.23 |
| Sherlock P值 | 0.987 |
| 胎儿β | -0.269 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 染色质重塑基因 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23709838 | X | 48768883 | HDAC6 | 1.937E-4 | 4.491 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG09928375 | X | 48568145-48568194 | HDAC6 | 0.001 | 3.937 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG14520448 | X | 48755206 | HDAC6 | 7.308E-4 | 3.462 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | HDAC6 | 10013 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta Carm er途径 | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HDAC Classii途径 | 34 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HDAC Classi途径 | 66 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Notch1细胞内结构域调节转录 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Notch1的Reactome信号传导 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Notch的Reactome信号传导 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对Bexarotene的反应 | 34 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BMYB多态性变体DN的SCHWAB靶标 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 | 176 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向 | 112 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |