基因页：SH2B3
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| GeneID | 10019 |
| Symbol | SH2B3 |
| 同义词 | IDDM20 | LNK |
| 描述 | SH2B adaptor protein 3 |
| 参考 | MIM：605093|HGNC：HGNC：29605|ENSEMBL：ENSG00000111252|HPRD：05480|Vega：Otthumg00000169550 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q24 |
| Pascal P值 | 0.29 |
| Sherlock P值 | 0.772 |
| DEG P值 | DEG：Maycox_2009：cc_ba10_fold_change = 1.11：cc_ba10_disease_p = 0.0108：hbb_ba9_fold_change = -1.09：hbb_ba9_disease_p = 0.0325 |
| 胎儿β | -0.14 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 伏隔核基底神经节 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| 网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献：0.0132 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02298094 | 12 | 111844676 | SH2B3 | 1.558E-4 | 0.429 | 0.032 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007242 | 细胞内信号传导级联 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| GO：0035162 | 胚胎造血 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | 艾达 | 18029348 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 573 | 579 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-101 | 3230 | 3237 | 1A，M8 | hsa-miR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| mir-124.1 | 869 | 875 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-124/506 | 868 | 875 | 1A，M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-125/351 | 811 | 817 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG | ||||
| miR-138 | 2836 | 2842 | 1a | HSA-MIR-138脑 | Agcugguuguguugaauc |
| HSA-MIR-138脑 | Agcugguuguguugaauc | ||||
| mir-144 | 3231 | 3237 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
| mir-223 | 345 | 351 | 1a | hsa-miR-223 | ugucuuugucaauacccc |
| mir-24 | 707 | 714 | 1A，M8 | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
| mir-326 | 90 | 96 | 1a | hsa-miR-326 | CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG |
| mir-33 | 3258 | 3264 | 1a | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
| HSA-MIR-33b | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
| miR-493-5p | 3276 | 3283 | 1A，M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-9 | 2797 | 2804 | 1A，M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |