基因页：猪
概括？
| 基因 | 10026 |
| 象征 | 猪 |
| 同义词 | GPI8 |
| 描述 | 磷脂酰肌醇聚糖锚固生物合成k类 |
| 参考 | MIM：605087|HGNC：HGNC：8965|ENSEMBL：ENSG00000142892|HPRD：05474|Vega：Otthumg00000009686 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p31.1 |
| Pascal P值 | 0.344 |
| Sherlock P值 | 0.758 |
| 胎儿β | -1.031 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02692 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12655452 | 1 | 77685094 | 猪 | 4.86e-5 | -0.432 | 0.021 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18299211 | 1 | 77685015 | 猪 | 5.64e-8 | -0.012 | 1.45e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KIAA0174 | 0.86 | 0.86 |
| HeaTr6 | 0.86 | 0.86 |
| stt3a | 0.85 | 0.86 |
| C9orf64 | 0.85 | 0.85 |
| prPSAP1 | 0.85 | 0.86 |
| CAPN7 | 0.84 | 0.85 |
| TSR1 | 0.84 | 0.84 |
| C17orf71 | 0.84 | 0.85 |
| PPP1R8 | 0.84 | 0.86 |
| rspry1 | 0.84 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.79 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.67 | -0.80 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.74 |
| ifi27 | -0.65 | -0.72 |
| AF347015.2 | -0.63 | -0.76 |
| C5orf53 | -0.63 | -0.66 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003923 | GPI锚定跨成绩酶活性 | 小鬼 | 10793132 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10793132|11483512 | |
| 去：0004197 | 半胱氨酸型内肽酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
| GO：0034235 | GPI锚固结合 | 塔斯 | 10793132 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006467 | 蛋白质硫醇 - 硫化物交换 | 塔斯 | 12582175 | |
| 去：0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
| GO：0016255 | GPI锚定在蛋白质上 | 经验 | 1846368 | |
| GO：0016255 | GPI锚定在蛋白质上 | 塔斯 | 11483512 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0042765 | GPI锚式跨成绩复合物 | 小鬼 | 10793132 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG糖基磷脂酰肌醇GPI锚固生物合成 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome的翻译后修饰合成GPI锚定蛋白 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 威廉姆斯ESR2瞄准 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ellwood MYC的目标 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-410 | 2701 | 2707 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |