基因页:DNAJB6
概括?
基因 | 10049 |
象征 | DNAJB6 |
同义词 | DJ4 | DNAJ | HHDJ1 | HSJ-2 | HSJ2 | LGMD1D | LGMD1E | MRJ | MSJ-1 |
描述 | DNAJ热休克蛋白家族(HSP40)成员B6 |
参考 | MIM:611332|HGNC:HGNC:14888|Ensembl:ENSG00000105993|HPRD:07107|Vega:Otthumg00000157242 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q36.3 |
Pascal P值 | 0.612 |
Sherlock P值 | 0.909 |
胎儿β | 0.271 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG17950348 | 7 | 157183466 | DNAJB6 | 5.474E-4 | 0.293 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DNAJB6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPAA1 | 0.80 | 0.80 |
WDR45 | 0.80 | 0.78 |
rabggta | 0.79 | 0.78 |
HM13 | 0.79 | 0.76 |
CYB561D2 | 0.79 | 0.84 |
yipf2 | 0.79 | 0.78 |
HPS1 | 0.78 | 0.79 |
TMEM222 | 0.78 | 0.77 |
格里纳 | 0.78 | 0.76 |
CYHR1 | 0.77 | 0.78 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.52 | -0.52 |
MT-ATP8 | -0.52 | -0.50 |
AF347015.21 | -0.50 | -0.48 |
SEC62 | -0.49 | -0.57 |
AF347015.8 | -0.48 | -0.43 |
AC010300.1 | -0.47 | -0.53 |
AF347015.27 | -0.45 | -0.43 |
AL139819.3 | -0.45 | -0.47 |
MT-CO2 | -0.45 | -0.40 |
AF347015.31 | -0.44 | -0.38 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应蓝色 | 136 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AKL HTLV1感染DN | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺DN的反应 | 84 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁与HDAC互动 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 | 87 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 8Q24 DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCIAN反转TP53和TP73 DN的目标 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim生发中心T助手 | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期峰值2小时 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rampon丰富学习环境早期DN | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir133靶向 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |