基因页：CDH7
概括？
| 基因 | 1005 |
| 象征 | CDH7 |
| 同义词 | CDH7L1 |
| 描述 | 钙粘蛋白7 |
| 参考 | MIM：605806|HGNC：HGNC：1766|Ensembl：ENSG00000081138|HPRD：12049|Vega：Otthumg00000132800 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 18Q22.1 |
| Pascal P值 | 0.082 |
| 胎儿β | -1.913 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | 细胞粘附和透射信号传导 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CDH7 | 1005 | 4.312E-4 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CDH7 | 1005 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FRMPD4 | 0.76 | 0.81 |
| PCDHA5 | 0.76 | 0.78 |
| RIMBP2 | 0.75 | 0.79 |
| DLG3 | 0.75 | 0.75 |
| LMTK2 | 0.74 | 0.75 |
| Arhgef3 | 0.74 | 0.77 |
| inpp4a | 0.74 | 0.76 |
| Lingo2 | 0.73 | 0.74 |
| Epha4 | 0.73 | 0.80 |
| DLG2 | 0.73 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AP002478.3 | -0.49 | -0.55 |
| FXYD1 | -0.47 | -0.46 |
| ACSF2 | -0.47 | -0.52 |
| AL139819.3 | -0.47 | -0.49 |
| AC021016.1 | -0.46 | -0.48 |
| AF347015.21 | -0.46 | -0.48 |
| TLCD1 | -0.46 | -0.46 |
| C11orf67 | -0.45 | -0.52 |
| AF347015.33 | -0.45 | -0.45 |
| MT-CO2 | -0.45 | -0.49 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Adherens连接相互作用 | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞连接组织 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞连接组织 | 78 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 | 70 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |