基因页:SLC17A4
概括?
基因 | 10050 |
象征 | SLC17A4 |
同义词 | KAIA2138 |
描述 | Solute Carrier家族17成员4 |
参考 | MIM:604216|HGNC:HGNC:10932|ENSEMBL:ENSG00000146039|HPRD:05022|Vega:Otthumg0000000014410 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.2 |
Pascal P值 | 2.195E-7 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16869851 | CHR4 | 20690056 | SLC17A4 | 10050 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC17A4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf124 | 0.78 | 0.74 |
SLC35F5 | 0.78 | 0.76 |
PTCD3 | 0.77 | 0.71 |
arfip1 | 0.77 | 0.73 |
AC012100.1 | 0.76 | 0.77 |
C5orf33 | 0.76 | 0.73 |
PGM3 | 0.76 | 0.74 |
达斯 | 0.76 | 0.70 |
Erlin2 | 0.76 | 0.71 |
Narg2 | 0.76 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.57 | -0.52 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.53 |
AF347015.27 | -0.51 | -0.51 |
AF347015.8 | -0.51 | -0.51 |
AF347015.31 | -0.50 | -0.52 |
mt-cyb | -0.50 | -0.50 |
AF347015.33 | -0.49 | -0.49 |
IL32 | -0.49 | -0.41 |
ifi27 | -0.49 | -0.48 |
higd1b | -0.46 | -0.45 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005436 | 钠:磷酸盐分类蛋白活性 | 塔斯 | 10319585 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
GO:0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
GO:0031402 | 钠离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006814 | 钠离子运输 | 塔斯 | 10319585 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0006796 | 磷酸盐代谢过程 | 塔斯 | 10319585 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 10319585 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10319585 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |