概括
基因 10050
象征 SLC17A4
同义词 KAIA2138
描述 Solute Carrier家族17成员4
参考 MIM:604216|HGNC:HGNC:10932|ENSEMBL:ENSG00000146039|HPRD:05022|Vega:Otthumg0000000014410
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.2
Pascal P值 2.195E-7
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 SLC17A4 10050 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf124 0.78 0.74
SLC35F5 0.78 0.76
PTCD3 0.77 0.71
arfip1 0.77 0.73
AC012100.1 0.76 0.77
C5orf33 0.76 0.73
PGM3 0.76 0.74
达斯 0.76 0.70
Erlin2 0.76 0.71
Narg2 0.76 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.57 -0.52
MT-CO2 -0.55 -0.53
AF347015.27 -0.51 -0.51
AF347015.8 -0.51 -0.51
AF347015.31 -0.50 -0.52
mt-cyb -0.50 -0.50
AF347015.33 -0.49 -0.49
IL32 -0.49 -0.41
ifi27 -0.49 -0.48
higd1b -0.46 -0.45

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005436 钠:磷酸盐分类蛋白活性 塔斯 10319585
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
GO:0015293 分类者活动 IEA -
GO:0031402 钠离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006814 钠离子运输 塔斯 10319585
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006796 磷酸盐代谢过程 塔斯 10319585
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005624 膜分数 塔斯 10319585
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10319585

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因