概括
基因 10056
象征 法尔斯布
同义词 farslb | frsb | hspc173 | phehb | phers
描述 苯基烷基-TRNA合成酶β亚基
参考 MIM:609690|HGNC:HGNC:17800|HPRD:09947|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q36.1
Pascal P值 0.707
胎儿β -0.19
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00916
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01016

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25545336 2 223520958 法尔斯布 1.86E-8 -0.023 6.61E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
fibcd1 0.58 0.39
C2ORF85 0.57 0.28
CNGB1 0.56 0.49
SUSD4 0.56 0.54
aqp3 0.55 0.28
Prkcg 0.53 0.51
卡车 0.52 0.46
drd5 0.51 0.45
DNAJC12 0.51 0.49
GABRQ 0.51 0.42
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMTN -0.29 -0.36
AL953897.2 -0.28 -0.21
C1orf187 -0.26 -0.15
AC005035.1 -0.26 -0.31
neo1 -0.25 -0.24
KIAA1949 -0.25 -0.21
Edaradd -0.25 -0.26
RBMX2 -0.25 -0.30
SLC44A5 -0.25 -0.13
LPL -0.25 -0.22

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004826 苯丙氨酸-tRNA连接酶活性 塔斯 10049785
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006432 苯基烷基-TRNA氨基酰化 IEA -
去:0006412 翻译 塔斯 10049785
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005625 可溶性部分 塔斯 10049785
去:0005737 细胞质 塔斯 10049785

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对Cantharidin DN的反应 69 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴尔基癌俯卧反应BPA 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因