基因页面:CDH9

总结吗?
GeneID 1007年
象征 CDH9
同义词 - - - - - -
描述 钙粘着蛋白9
参考 MIM: 609974|HGNC: HGNC: 1768|运用:ENSG00000113100|HPRD: 13021|织女:OTTHUMG00000090671
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5好
帕斯卡假定值 0.803
夏洛克假定值 0.443
胎儿β -3.396
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 细胞粘附和TRANSSYNAPTIC信号

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs994307 chr7 9179288 CDH9 1007年 0.17 反式
rs4789947 chr17 77135790 CDH9 1007年 0.11 反式
rs1795952 chr17 77136677 CDH9 1007年 0.11 反式
rs2707040 chr17 77136833 CDH9 1007年 0.11 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
PCDHAC2 0.86 0.88
PCDHA5 0.84 0.84
JAZF1 0.82 0.85
PRPS2 0.81 0.84
STXBP5 0.81 0.85
BTBD1 0.81 0.82
GPR176 0.80 0.85
CADM3 0.80 0.84
SNAP91 0.80 0.86
rp4 - 788 l13.1 0.80 0.84
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AP002478.3 -0.52 -0.59
C11orf67 -0.52 -0.58
AF347015.21 -0.50 -0.50
MT-CO2 -0.49 -0.52
ACSF2 -0.49 -0.55
AF347015.26 -0.49 -0.48
EIF4EBP3 -0.48 -0.53
AF347015.31 -0.48 -0.50
FXYD1 -0.48 -0.46
AF347015.2 -0.47 -0.47

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
REACTOME细胞细胞通讯 120年 77年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME交互粘合连接处并且 27 20. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞细胞连接组织 56 31日 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞组织结 78年 43 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合6小时 85年 54 所有SZGR 2.0基因通路