基因页面:SNUPN
总结吗?
GeneID | 10073年 |
象征 | SNUPN |
同义词 | KPNBL | RNUT1 | Snurportin1 |
描述 | snurportin 1 |
参考 | MIM: 607902|HGNC: HGNC: 14245|运用:ENSG00000169371|HPRD: 07441|织女:OTTHUMG00000142833 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 15 q24.2 |
帕斯卡假定值 | 0.398 |
夏洛克假定值 | 0.426 |
胎儿β | -0.205 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 伏隔核基底神经节 元 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg15811902 | 15 | 75918385 | SNUPN | 3.107的军医 | -0.26 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SNUPN_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM54B | 0.63 | 0.62 |
CIRH1A | 0.62 | 0.61 |
MED8 | 0.62 | 0.61 |
MLX | 0.61 | 0.59 |
FBXO22 | 0.61 | 0.57 |
TTC9C | 0.60 | 0.57 |
ANAPC5 | 0.60 | 0.59 |
PSMA1 | 0.60 | 0.59 |
PREB | 0.60 | 0.56 |
SLC25A38 | 0.60 | 0.58 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.54 | -0.60 |
AF347015.8 | -0.52 | -0.49 |
AF347015.26 | -0.52 | -0.52 |
AL139819.3 | -0.51 | -0.48 |
AF347015.27 | -0.49 | -0.49 |
MT-CO2 | -0.49 | -0.45 |
MT-ATP8 | -0.49 | -0.48 |
AF347015.21 | -0.48 | -0.45 |
AF347015.15 | -0.48 | -0.47 |
AF347015.2 | -0.47 | -0.45 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME代谢非编码RNA | 49 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA代谢 | 330年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血作用中间祖 | 149年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WHITFIELD细胞周期G1 | 148年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |