概括
基因 10079
象征 atp9a
同义词 Atpiia
描述 ATPase磷脂运输9A(推定)
参考 MIM:609126|HGNC:HGNC:13540|Ensembl:ENSG00000054793|HPRD:18541|Vega:Otthumg0000000032751
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.2
Pascal P值 0.246
胎儿β -0.002
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21380183 20 50312632 atp9a 1.398E-4 -0.949 0.031 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NIT2 0.38 0.22
BNC1 0.38 0.10
stab2 0.38 0.23
tnfaip8l3 0.38 0.28
S100A10 0.38 0.13
hexa 0.36 0.25
C7orf44 0.36 0.21
IL13RA2 0.35 0.26
C1QTNF3 0.35 0.21
apoa1bp 0.35 0.22
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nkapl -0.16 -0.14
TAF3 -0.15 -0.10
CWF19L2 -0.15 -0.13
sema3f -0.15 -0.07
RP4-697K14.1 -0.15 -0.08
lyg2 -0.15 -0.10
CDH6 -0.14 -0.06
klhl1 -0.14 0.00
Sox5 -0.14 -0.01
PELI2 -0.14 -0.03

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
P型ATPases的Reactome离子传输 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome离子通道传输 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江是衰老下丘脑DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤复制号码 73 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buckanovich T淋巴细胞在肿瘤DN上 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因