基因页:CDH10
概括?
基因 | 1008 |
象征 | CDH10 |
同义词 | - |
描述 | 钙粘蛋白10 |
参考 | MIM:604555|HGNC:HGNC:1749|ENSEMBL:ENSG00000040731|HPRD:05187|Vega:Otthumg0000000090667 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5p14.2 |
Pascal P值 | 0.004 |
Sherlock P值 | 0.715 |
胎儿β | -0.765 |
支持 | 细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CDH10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Gabra6 | 0.76 | 0.22 |
CBLN3 | 0.74 | 0.07 |
PCP2 | 0.54 | 0.27 |
RP13-102H20.1 | 0.51 | 0.23 |
fat2 | 0.48 | 0.35 |
GRM4 | 0.43 | 0.39 |
crtam | 0.42 | 0.24 |
cdc42bpg | 0.42 | 0.40 |
RGS3 | 0.36 | 0.39 |
DOK7 | 0.35 | 0.32 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C6orf142 | -0.18 | -0.17 |
FBXW7 | -0.18 | -0.10 |
DPP4 | -0.18 | -0.13 |
AC016910.1 | -0.18 | -0.11 |
GPR22 | -0.18 | -0.13 |
GTDC1 | -0.18 | -0.14 |
SATB1 | -0.17 | -0.10 |
Cidea | -0.17 | -0.13 |
SLC26A4 | -0.17 | -0.17 |
MCTP1 | -0.16 | -0.11 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Adherens连接相互作用 | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞连接组织 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞连接组织 | 78 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alonso转移EMT DN | 5 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移DN | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |