基因页：GPC6

概括？
基因 10082
象征 GPC6
同义词 OMIMD1
描述 Glypican 6
参考 MIM：604404|HGNC：HGNC：4454|Ensembl：ENSG00000183098|HPRD：05099|Vega：Otthumg0000000017205
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q32
Pascal P值 0.004
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG23246978 13 93879042 GPC6 -0.027 0.41 DMG：Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
thumpd1 0.94 0.95
NFX1 0.94 0.94
terf2 0.93 0.94
jakmip2 0.93 0.94
TP53BP1 0.93 0.94
ZNF134 0.93 0.94
ZNF623 0.93 0.95
Arih1 0.93 0.94
HMG20A 0.93 0.94
SRGAP2P2 0.93 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.78 -0.86
MT-CO2 -0.77 -0.86
FXYD1 -0.77 -0.86
AF347015.27 -0.76 -0.84
AF347015.33 -0.75 -0.82
AF347015.8 -0.74 -0.85
mt-cyb -0.74 -0.82
higd1b -0.74 -0.84
HSD17B14 -0.74 -0.79
ifi27 -0.74 -0.83

第三节。基因本体论注释

细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
去：0005578 蛋白质的细胞外基质 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 10329016
GO：0031225 锚定在膜上 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome HS堵嘴降解 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HS GAG生物合成 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GAG合成需要四糖接头序列 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标D DN 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 229 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Medina Smarca4目标 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CCND1和CDK4 DN的Molenaar靶标 58 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sharma毛囊星形胶质细胞瘤位置 25 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir133靶向 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM有关联 171 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 289 296 1A，M8 HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-376 109 115 M8 HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-431 396 402 1a HSA-MIR-431 uguugcaggccguauga
mir-9 156 162 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga