基因页:USH1C
概括?
基因 | 10083 |
象征 | USH1C |
同义词 | AIE-75 | DFNB18 | DFNB18A | NY-CO-37 | NY-CO-38 | PDZ-45 | PDZ-73 | PDZ-73 | PDZ-73/NY-CO-38 | PDZ73 | PDZ73 | PDZD7C | USH1CPST | USH1CPST |
描述 | USH1蛋白网络组件和声 |
参考 | MIM:605242|HGNC:HGNC:12597|Ensembl:ENSG00000006611|HPRD:09241|Vega:Otthumg00000166323 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P14.3 |
Pascal P值 | 0.013 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/USH1C_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF830 | 0.85 | 0.88 |
GTPBP4 | 0.85 | 0.87 |
MRFAP1L1 | 0.85 | 0.89 |
EIF4E2 | 0.84 | 0.87 |
PPP2R2D | 0.84 | 0.86 |
GLOD4 | 0.84 | 0.87 |
Spats2 | 0.84 | 0.86 |
ankle2 | 0.84 | 0.86 |
RNF34 | 0.83 | 0.84 |
terf1 | 0.83 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.79 |
FXYD1 | -0.74 | -0.78 |
mt-cyb | -0.74 | -0.78 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.79 |
AF347015.2 | -0.73 | -0.76 |
AF347015.15 | -0.72 | -0.78 |
AF347015.26 | -0.71 | -0.75 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta TID途径 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jeon SMAD6靶向DN | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
安倍的内耳 | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU被膀胱癌中的甲基化沉默 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王复发性肝癌 | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇5 dn | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |