概括
基因 10083
象征 USH1C
同义词 AIE-75 | DFNB18 | DFNB18A | NY-CO-37 | NY-CO-38 | PDZ-45 | PDZ-73 | PDZ-73 | PDZ-73/NY-CO-38 | PDZ73 | PDZ73 | PDZD7C | USH1CPST | USH1CPST
描述 USH1蛋白网络组件和声
参考 MIM:605242|HGNC:HGNC:12597|Ensembl:ENSG00000006611|HPRD:09241|Vega:Otthumg00000166323
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P14.3
Pascal P值 0.013

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF830 0.85 0.88
GTPBP4 0.85 0.87
MRFAP1L1 0.85 0.89
EIF4E2 0.84 0.87
PPP2R2D 0.84 0.86
GLOD4 0.84 0.87
Spats2 0.84 0.86
ankle2 0.84 0.86
RNF34 0.83 0.84
terf1 0.83 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.77 -0.79
AF347015.33 -0.75 -0.78
AF347015.31 -0.75 -0.79
FXYD1 -0.74 -0.78
mt-cyb -0.74 -0.78
AF347015.8 -0.74 -0.78
AF347015.27 -0.73 -0.79
AF347015.2 -0.73 -0.76
AF347015.15 -0.72 -0.78
AF347015.26 -0.71 -0.75

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta TID途径 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jeon SMAD6靶向DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
安倍的内耳 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU被膀胱癌中的甲基化沉默 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王复发性肝癌 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇5 dn 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因