概括
基因 10090
象征 Ust
同义词 2ost
描述 Uronyl 2-硫代转移酶
参考 MIM:610752|HGNC:HGNC:17223|ENSEMBL:ENSG00000111962|HPRD:10298|Vega:Otthumg0000000016135
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q25.1
Pascal P值 0.397
Sherlock P值 0.623
胎儿β 0.312
主持人 尾状基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10186260 CHR2 129538777 Ust 10090 0.09 反式
RS2683815 CHR2 142078002 Ust 10090 0.02 反式
RS12490351 CHR3 191894097 Ust 10090 0.17 反式
RS1460926 CHR3 191894249 Ust 10090 0.17 反式
RS1981925 CHR4 34348578 Ust 10090 0.16 反式
RS2268637 CHR6 39050917 Ust 10090 0.13 反式
RS17836464 CHR12 4066927 Ust 10090 0 反式
RS16947436 CHR13 92988845 Ust 10090 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
hnrnph1 0.97 0.98
hnrnpu 0.97 0.97
NCBP2 0.97 0.96
top2b 0.96 0.97
DHX9 0.96 0.95
CNOT2 0.96 0.95
CTCF 0.96 0.97
SUPT16H 0.96 0.96
EPC1 0.96 0.96
KHDRBS1 0.96 0.97
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.76 -0.91
HLA-F -0.76 -0.80
AIFM3 -0.75 -0.80
AF347015.27 -0.74 -0.89
MT-CO2 -0.74 -0.91
FXYD1 -0.74 -0.90
TSC22D4 -0.74 -0.83
C5orf53 -0.74 -0.76
ifi27 -0.73 -0.89
S100B -0.73 -0.83

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008146 硫代转移酶活性 塔斯 10187838
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006477 蛋白氨基酸硫酸盐 塔斯 10187838
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 塔斯 10187838

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖胺聚糖生物合成软骨素硫酸盐 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci侵入性癌导管与小叶 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 114 120 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-150 136 143 1A,M8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-155 97 103 1a HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-369-3p 2604 2610 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 2604 2611 1A,M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-378 2642 2648 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-409-3p 113 119 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-433-3p 1865年 1871年 M8 HSA-MIR-433 aucaugauggggcuccucggugu
HSA-MIR-433 aucaugauggggcuccucggugu