基因页:Ust
概括?
基因 | 10090 |
象征 | Ust |
同义词 | 2ost |
描述 | Uronyl 2-硫代转移酶 |
参考 | MIM:610752|HGNC:HGNC:17223|ENSEMBL:ENSG00000111962|HPRD:10298|Vega:Otthumg0000000016135 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q25.1 |
Pascal P值 | 0.397 |
Sherlock P值 | 0.623 |
胎儿β | 0.312 |
主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10186260 | CHR2 | 129538777 | Ust | 10090 | 0.09 | 反式 | ||
RS2683815 | CHR2 | 142078002 | Ust | 10090 | 0.02 | 反式 | ||
RS12490351 | CHR3 | 191894097 | Ust | 10090 | 0.17 | 反式 | ||
RS1460926 | CHR3 | 191894249 | Ust | 10090 | 0.17 | 反式 | ||
RS1981925 | CHR4 | 34348578 | Ust | 10090 | 0.16 | 反式 | ||
RS2268637 | CHR6 | 39050917 | Ust | 10090 | 0.13 | 反式 | ||
RS17836464 | CHR12 | 4066927 | Ust | 10090 | 0 | 反式 | ||
RS16947436 | CHR13 | 92988845 | Ust | 10090 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UST_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hnrnph1 | 0.97 | 0.98 |
hnrnpu | 0.97 | 0.97 |
NCBP2 | 0.97 | 0.96 |
top2b | 0.96 | 0.97 |
DHX9 | 0.96 | 0.95 |
CNOT2 | 0.96 | 0.95 |
CTCF | 0.96 | 0.97 |
SUPT16H | 0.96 | 0.96 |
EPC1 | 0.96 | 0.96 |
KHDRBS1 | 0.96 | 0.97 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.91 |
HLA-F | -0.76 | -0.80 |
AIFM3 | -0.75 | -0.80 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.91 |
FXYD1 | -0.74 | -0.90 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.83 |
C5orf53 | -0.74 | -0.76 |
ifi27 | -0.73 | -0.89 |
S100B | -0.73 | -0.83 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008146 | 硫代转移酶活性 | 塔斯 | 10187838 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006477 | 蛋白氨基酸硫酸盐 | 塔斯 | 10187838 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | 塔斯 | 10187838 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖胺聚糖生物合成软骨素硫酸盐 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci侵入性癌导管与小叶 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 114 | 120 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua | ||||
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-150 | 136 | 143 | 1A,M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
mir-155 | 97 | 103 | 1a | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
mir-369-3p | 2604 | 2610 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 2604 | 2611 | 1A,M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
mir-378 | 2642 | 2648 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-409-3p | 113 | 119 | M8 | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |
mir-433-3p | 1865年 | 1871年 | M8 | HSA-MIR-433脑 | aucaugauggggcuccucggugu |
HSA-MIR-433脑 | aucaugauggggcuccucggugu |