概括
基因 10099
象征 TSPAN3
同义词 TM4-A | TM4SF8 | TSPAN-3
描述 四翼烷蛋白3
参考 MIM:613134|HGNC:HGNC:17752|HPRD:15512|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q24.3
Pascal P值 0.524
胎儿β -0.362
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02548606 15 77363299 TSPAN3 7.04e-8 -0.007 1.7e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NUBP2 0.91 0.92
exosc4 0.90 0.92
应付 0.90 0.90
DCTN3 0.90 0.91
SF3B5 0.90 0.93
exosc5 0.89 0.92
MRPS34 0.89 0.91
GPS1 0.89 0.92
ALKBH7 0.88 0.87
C16orf84 0.88 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.26 -0.64 -0.75
AF347015.8 -0.62 -0.70
AF347015.15 -0.62 -0.71
mt-cyb -0.62 -0.71
AF347015.33 -0.61 -0.71
AF347015.2 -0.61 -0.70
AF347015.27 -0.60 -0.69
MT-CO2 -0.59 -0.66
MT-ATP8 -0.57 -0.72
apol1 -0.57 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合DN的Ebauer目标 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meinhold卵巢癌低级 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克莫昔芬的抵抗 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周TNF信号4小时 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan晚分化基因上升 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因