基因页：NUBP2

概括？
基因 10101
象征 NUBP2
同义词 CFD1 | NBP 2 | NUBP1
描述 核苷酸结合蛋白2
参考 MIM：610779|HGNC：HGNC：8042|Ensembl：ENSG0000000095906|HPRD：14846|Vega：Otthumg00000128639
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p13.3
Pascal P值 0.02
Sherlock P值 0.794
胎儿β 0.46
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02898499 16 1831468 SPSB3; NUBP2 5.915E-4 0.226 0.05 DMG：Wockner_2014
CG03700218 16 1832709 NUBP2 -0.021 0.29 DMG：Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2064289 CHR16 1593644 NUBP2 10101 0 顺式
RS2575369 CHR16 1817430 NUBP2 10101 0.11 顺式
RS3848346 CHR16 1889820 NUBP2 10101 9.793E-10 顺式
RS3848348 CHR16 1890055 NUBP2 10101 4.492E-9 顺式
RS1742419 CHR16 1901808 NUBP2 10101 1.101E-8 顺式
RS1625393 CHR16 1901892 NUBP2 10101 1.474E-9 顺式
RS1657117 CHR16 1903650 NUBP2 10101 1.474E-9 顺式
RS7199384 CHR16 1904586 NUBP2 10101 1.666E-7 顺式
RS453494 CHR16 1916102 NUBP2 10101 4.56e-9 顺式
RS1657094 CHR16 1920628 NUBP2 10101 1.521E-8 顺式
RS1657095 CHR16 1920677 NUBP2 10101 2.153E-7 顺式
RS2917523 CHR16 1920739 NUBP2 10101 5.921E-9 顺式
RS2974856 CHR16 1920756 NUBP2 10101 1.572E-7 顺式
RS2982235 CHR16 1920791 NUBP2 10101 1.616E-7 顺式
RS911392 CHR16 1947258 NUBP2 10101 9.888e-8 顺式
RS1742464 CHR16 1947334 NUBP2 10101 6.52E-8 顺式
RS2982447 CHR16 1947412 NUBP2 10101 1.21E-7 顺式
RS1742402 CHR16 1972815 NUBP2 10101 0.01 顺式
RS2064289 CHR16 1593644 NUBP2 10101 0.13 反式
RS3848346 CHR16 1889820 NUBP2 10101 2.406E-7 反式
RS3848348 CHR16 1890055 NUBP2 10101 1.097E-6 反式
RS1742419 CHR16 1901808 NUBP2 10101 2.621E-6 反式
RS1625393 CHR16 1901892 NUBP2 10101 3.607E-7 反式
RS1657117 CHR16 1903650 NUBP2 10101 3.607E-7 反式
RS7199384 CHR16 1904586 NUBP2 10101 3.624e-5 反式
RS453494 CHR16 1916102 NUBP2 10101 1.114E-6 反式
RS1657094 CHR16 1920628 NUBP2 10101 3.606E-6 反式
RS1657095 CHR16 1920677 NUBP2 10101 4.549E-5 反式
RS2917523 CHR16 1920739 NUBP2 10101 1.447E-6 反式
RS2974856 CHR16 1920756 NUBP2 10101 3.398E-5 反式
RS2982235 CHR16 1920791 NUBP2 10101 3.519E-5 反式
RS911392 CHR16 1947258 NUBP2 10101 2.149E-5 反式
RS1742464 CHR16 1947334 NUBP2 10101 1.463E-5 反式
RS2982447 CHR16 1947412 NUBP2 10101 2.661E-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PON2 0.89 0.89
aldh1l1 0.85 0.89
Stox1 0.82 0.86
hadhb 0.81 0.90
SLC44A3 0.81 0.79
PLSCR4 0.81 0.80
ranbp3l 0.81 0.88
Bbox1 0.80 0.87
GJA1 0.80 0.78
ADHFE1 0.80 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RUSC1 -0.62 -0.74
FAM40A -0.62 -0.72
RTF1 -0.62 -0.72
Rab35 -0.62 -0.74
L1CAM -0.62 -0.73
LSM14B -0.61 -0.71
3月4日 -0.61 -0.74
DPF1 -0.61 -0.73
SH3BP5 -0.61 -0.72
CSRNP2 -0.61 -0.74

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
UDayakumar Med1靶向 135 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应20 MCF10A 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌16p13 Amplicon 120 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因