概括
基因 1013
象征 CDH15
同义词 CDH14 | CDH3 | CDHM | MCAD | MRD3
描述 钙粘蛋白15
参考 MIM:114019|HGNC:HGNC:1754|Ensembl:ENSG00000129910|HPRD:00225|Vega:Otthumg00000138045
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q24.3
Pascal P值 0.002
胎儿β -0.015
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17392743 CHR1 54764240 CDH15 1013 0.15 反式
RS2502827 CHR1 176044216 CDH15 1013 0.12 反式
RS12405921 CHR1 206695730 CDH15 1013 0.07 反式
RS17572651 CHR1 218943612 CDH15 1013 0 反式
RS16829545 CHR2 151977407 CDH15 1013 3.942e-21 反式
RS16841750 CHR2 158288461 CDH15 1013 0.15 反式
RS3845734 CHR2 171125572 CDH15 1013 1.978E-4 反式
RS7584986 CHR2 184111432 CDH15 1013 2.859E-10 反式
RS2183142 CHR4 159232695 CDH15 1013 0.02 反式
RS1396222 CHR4 173279496 CDH15 1013 0.14 反式
RS335980 CHR4 173329784 CDH15 1013 0.07 反式
RS337984 CHR4 173411662 CDH15 1013 0.15 反式
RS17762315 CHR5 76807576 CDH15 1013 5.54e-4 反式
RS7729096 CHR5 76835927 CDH15 1013 0.16 反式
RS9461864 CHR6 33481468 CDH15 1013 0.06 反式
RS3118341 Chr9 25185518 CDH15 1013 0.05 反式
RS11139334 Chr9 84209393 CDH15 1013 0.01 反式
RS2393316 Chr10 59333070 CDH15 1013 0 反式
RS1526959 CHR12 79753789 CDH15 1013 0.11 反式
RS16955618 CHR15 29937543 CDH15 1013 3.157E-33 反式
RS16945437 CHR17 11797650 CDH15 1013 0.18 反式
RS11873184 CHR18 1584081 CDH15 1013 0.09 反式
RS1041786 CHR21 22617710 CDH15 1013 1.155E-5 反式
RS16986332 Chrx 10958354 CDH15 1013 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞通信 120 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Adherens连接相互作用 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞连接组织 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞连接组织 78 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肌发生 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jechlinger上皮到间充质转变 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤24小时 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发DN 65 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因