基因页：RBM12
概括？
| 基因 | 10137 |
| 象征 | RBM12 |
| 同义词 | HRIHFB2091 |天鹅 |
| 描述 | RNA结合基序蛋白12 |
| 参考 | MIM：607179|HGNC：HGNC：9898|ENSEMBL：ENSG00000244462|HPRD：06212|Vega：Otthumg0000000032350 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 20q11.21 |
| Pascal P值 | 0.895 |
| Sherlock P值 | 0.436 |
| 胎儿β | 2.112 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18497960 | 20 | 34253082 | RBM12 | -0.024 | 0.58 | DMG：Nishioka_2013 | |
| CG13136677 | 20 | 34253154 | RBM12 | 1.5e-8 | -0.025 | 5.7E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PIBF1 | 0.94 | 0.90 |
| RSL1D1 | 0.93 | 0.91 |
| RSRC2 | 0.93 | 0.91 |
| RBM39 | 0.93 | 0.92 |
| PRPF38B | 0.92 | 0.85 |
| RIOK2 | 0.92 | 0.91 |
| SMNDC1 | 0.92 | 0.90 |
| ZCCHC7 | 0.91 | 0.90 |
| CBX3 | 0.91 | 0.92 |
| SKIV2L2 | 0.91 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.62 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.61 | -0.81 |
| ifi27 | -0.61 | -0.83 |
| HLA-F | -0.60 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.60 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.60 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.59 | -0.79 |
| pth1r | -0.58 | -0.75 |
| FXYD1 | -0.58 | -0.79 |
| AIFM3 | -0.58 | -0.74 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌20q11扩增子 | 31 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |