概括
基因 10139
象征 ARFRP1
同义词 arl18 | arp | arp1
描述 ADP核糖基化因子相关蛋白1
参考 MIM:604699|HGNC:HGNC:662|ENSEMBL:ENSG00000101246|HPRD:05264|Vega:Otthumg0000000032993
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.3
Pascal P值 0.004
Sherlock P值 0.895
胎儿β -0.265
DMG 1(#研究)
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01756902 20 62340073 ARFRP1; ZGPAT 2.546E-4 0.559 0.037 DMG:Wockner_2014
CG03947749 20 62330072 ARFRP1 3.671E-4 0.354 0.042 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SKIV2L2 0.96 0.95
Cebpz 0.95 0.94
cdc5l 0.94 0.94
ppp1cc 0.93 0.92
线圈 0.93 0.93
RSL1D1 0.93 0.92
TAF7 0.93 0.93
dnttip2 0.93 0.93
MATR3 0.93 0.94
Narg1 0.93 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.69 -0.84
AF347015.31 -0.69 -0.84
AF347015.33 -0.68 -0.82
AF347015.27 -0.68 -0.82
mt-cyb -0.67 -0.83
AF347015.8 -0.67 -0.84
HLA-F -0.67 -0.77
AF347015.15 -0.66 -0.83
AF347015.2 -0.66 -0.83
ifi27 -0.65 -0.81

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 94 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因