基因页:ARFRP1
概括?
基因 | 10139 |
象征 | ARFRP1 |
同义词 | arl18 | arp | arp1 |
描述 | ADP核糖基化因子相关蛋白1 |
参考 | MIM:604699|HGNC:HGNC:662|ENSEMBL:ENSG00000101246|HPRD:05264|Vega:Otthumg0000000032993 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.3 |
Pascal P值 | 0.004 |
Sherlock P值 | 0.895 |
胎儿β | -0.265 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01756902 | 20 | 62340073 | ARFRP1; ZGPAT | 2.546E-4 | 0.559 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
CG03947749 | 20 | 62330072 | ARFRP1 | 3.671E-4 | 0.354 | 0.042 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARFRP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SKIV2L2 | 0.96 | 0.95 |
Cebpz | 0.95 | 0.94 |
cdc5l | 0.94 | 0.94 |
ppp1cc | 0.93 | 0.92 |
线圈 | 0.93 | 0.93 |
RSL1D1 | 0.93 | 0.92 |
TAF7 | 0.93 | 0.93 |
dnttip2 | 0.93 | 0.93 |
MATR3 | 0.93 | 0.94 |
Narg1 | 0.93 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.84 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.68 | -0.82 |
mt-cyb | -0.67 | -0.83 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.84 |
HLA-F | -0.67 | -0.77 |
AF347015.15 | -0.66 | -0.83 |
AF347015.2 | -0.66 | -0.83 |
ifi27 | -0.65 | -0.81 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 | 94 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |