基因页面:AKAP9
总结吗?
| GeneID | 10142年 |
| 象征 | AKAP9 |
| 同义词 | AKAP-9 | AKAP350 | AKAP450 | CG-NAP | HYPERION | LQT11 |μ- rms - 40.16 - | PPP1R45 | PRKA9 | YOTIAO |
| 描述 | 一种激酶锚定蛋白9 |
| 参考 | MIM: 604001|HGNC: HGNC: 379|运用:ENSG00000127914|HPRD: 04921|织女:OTTHUMG00000131127 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 q21-q22 |
| 帕斯卡假定值 | 0.111 |
| 胎儿β | 1.52 |
| 支持 | G2Cdb.humanNRC CompositeSet 达内尔FMRP目标 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.3189 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AKAP9 | chr7 | 91674467 | 一个 | T | NM_005751 NM_147185 |
p.1770I F > p.1770I F > |
错义 错义 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RHBDF2 | 0.47 | 0.52 |
| HMOX1 | 0.46 | 0.51 |
| C10orf54 | 0.46 | 0.51 |
| SERPINA1 | 0.45 | 0.40 |
| CD40 | 0.45 | 0.49 |
| TMBIM1 | 0.45 | 0.48 |
| CASS4 | 0.45 | 0.47 |
| SPI1 | 0.45 | 0.47 |
| NLRC5 | 0.44 | 0.46 |
| RAC2 | 0.44 | 0.47 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RTF1 | -0.30 | -0.31 |
| RP9 | -0.30 | -0.34 |
| MPHOSPH10 | -0.29 | -0.30 |
| CIR1 | -0.29 | -0.32 |
| RBMX2 | -0.29 | -0.33 |
| NOVA1 | -0.29 | -0.29 |
| THOC2 | -0.29 | -0.31 |
| RIOK1 | -0.28 | -0.29 |
| RSBN1L | -0.28 | -0.30 |
| ZNF30 | -0.28 | -0.30 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005102 | 受体结合 | 助教 | 神经递质(术语级别:4) | 9482789 |
| 去:0016301 | 激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 9482789 |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 10390370 | |
| 去:0006810 | 运输 | 助教 | 10390370 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005813 | 中心体 | 助教 | 10202149 | |
| 去:0005856 | 细胞骨架 | 助教 | 9482789 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CALM1 | CALML2 |哥伦比亚公司| DD132 | PHKD | 钙调蛋白1(磷酸化酶激酶,δ) | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 12221128 |
| CALM2 | CAMII | PHKD | PHKD2 | 钙调蛋白2(磷酸化酶激酶,δ) | 2台混合动力 | BioGRID | 12221128 |
| CLIC1 | G6 | NCC27 | 氯细胞内通道1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12163479 |
| CSNK1D | HCKID | 酪蛋白激酶1,三角洲 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12270714 |
| CSNK1E | HCKIE | MGC10398 | 酪蛋白激酶1,ε | - - - - - - | HPRD | 12270714 |
| FNBP1 | FBP17 | KIAA0554 | MGC126804 | 甲酸精结合蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15047863 |
| GRIN1 | NMDA1 | NMDAR1 | NR1 | 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 1 | - - - - - - | HPRD | 9482789 | 9482789 |
| GRIN1 | NMDA1 | NMDAR1 | NR1 | 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 1 | - - - - - - | HPRD | 10862698 |
| KCNQ1 | ATFB1 | FLJ26167 | JLNS1 | KCNA8 | KCNA9 | KVLQT1 | Kv1.9 | Kv7.1 | LQT | LQT1 |遥控武器站| SQT2 |采用 | 电压门控钾通道,KQT-like亚科,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11799244 |
| 资金 | 肯| MOPD2 | PCN | PCNT2 | PCNTB | PCTN2 | SCKL4 | pericentrin | - - - - - - | HPRD | 12221128 |
| PKN1 | 它们的| MGC46204 | PAK1 |波兰| PKN-ALPHA | PRK1 | PRKCL1 | 蛋白激酶N1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10358086 |
| PPP1CA | MGC15877 | MGC1674 | PP-1A | PPP1A | 蛋白磷酸酶1催化亚基α同种型 | - - - - - - | HPRD | 10358086 |
| PPP2R1B | MGC26454 | PR65B | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,β同种型 | - - - - - - | HPRD | 10358086 |
| PRKAR2A | MGC3606 | PKR2 | PRKAR2 | 蛋白激酶,cAMP-dependent、监管、II型α | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10358086 |
| PRKAR2A | MGC3606 | PKR2 | PRKAR2 | 蛋白激酶,cAMP-dependent、监管、II型α | - - - - - - | HPRD | 10358086|11799244 |
| PRKAR2B | PRKAR2 | RII-BETA | 蛋白激酶,cAMP-dependent、监管、II型β | - - - - - - | HPRD | 11799244 |
| PRKCE | MGC125656 | MGC125657 | PKCE | nPKC-epsilon | 蛋白激酶C,ε | - - - - - - | HPRD | 10945988 |
| TACC3 | ERIC1 | MGC117382 | MGC133242 | 改变,含蛋白质酸性卷曲螺旋3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12015314 |
| TRIP10 | CIP4 | HSTP |小公牛| STP | 甲状腺激素受体关联10 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 15047863 |
| TSNAX | TRAX | translin-associated因子X | - - - - - - | HPRD | 12036294 |
| TUBGCP3 | GCP3 | SPBC98 | Spc98p | 微管蛋白γ复杂蛋白质3有关 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12221128 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| BIOCARTA AKAPCENTROSOME通路 | 15 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞周期 | 421年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在化学突触REACTOME传输 | 186年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞周期有丝分裂 | 325年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME招聘有丝分裂中心体蛋白复合物 | 66年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 有丝分裂的NLP中心体REACTOME损失 | 59 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经递质受体结合和下游传播的突触后细胞 | 137年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RAS激活机制CA2 INFUX通过NMDA受体 | 17 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME激活谷氨酸NMDA受体在绑定和突触后的事件 | 37 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME磷酸化分子通过RAS的激活 | 27 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME NMDA受体激活后的事件 | 33 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME解锁NMDA谷氨酸受体绑定并激活 | 15 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME磷酸化分子通过CAMKII的激活 | 15 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME有丝分裂G2 G2 M阶段 | 81年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 威尔科特斯回应黄体酮DN | 66年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多恩对雄激素DN | 241年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿克勒说道HTLV1感染DN | 68年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 | 418年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 长岛NRG1信号DN | 58 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOKKINAKIS蛋氨酸剥夺48小时DN | 64年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOKKINAKIS蛋氨酸不足96小时DN | 75年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCBRYAN发育期乳房5 6周DN | 137年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCBRYAN发育期乳房6 7周 | 197年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| APPIERTO FENRETINIDE反应 | 38 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 农民乳腺癌顶浆分泌和基底 | 330年 | 217年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌7的时候扩增子对方篮里 | 76年 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY突变在乳腺癌和放大 | 94年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丁肺癌拷贝数的表达式 | One hundred. | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NING慢性阻塞性肺病DN | 121年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 谢泼德粉碎和燃烧突变DN | 185年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病早期布莱洛克的了 | 390年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 击倒老化肌肉了 | 244年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张乳腺癌的祖细胞 | 425年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ICHIBA移植物抗宿主病D7 | 107年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TAVAZOIE转移 | 108年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 姚明时间响应黄体酮集群2 | 86年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IKEDA MIR133目标了 | 43 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PLASARI TGFB1信号通过NFIC 1小时DN | 106年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG EGF间隔DN | 214年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |