概括
基因 10150
象征 MBNL2
同义词 mbll | mbll39 | pro2032
描述 像剪接调节器2
参考 MIM:607327|HGNC:HGNC:16746|Ensembl:ENSG00000139793|HPRD:09543|Vega:Otthumg0000000017239
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q32.1
Pascal P值 0.137
Sherlock P值 0.605
胎儿β -2.439
主持人 下丘脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16952071 CHR13 97986447 MBNL2 10150 0.18 顺式
RS7318821 CHR13 97988346 MBNL2 10150 0.18 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
clptm1l 0.92 0.93
L3MBTL2 0.91 0.91
PGS1 0.91 0.90
COG8 0.91 0.89
VPS18 0.90 0.91
USP5 0.90 0.90
DGCR2 0.90 0.89
GDI1 0.89 0.88
DHX30 0.89 0.87
ARF1 0.89 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.75 -0.72
MT-CO2 -0.75 -0.71
AF347015.2 -0.73 -0.67
AF347015.8 -0.73 -0.71
AF347015.21 -0.73 -0.73
mt-cyb -0.72 -0.68
AF347015.33 -0.71 -0.67
higd1b -0.70 -0.67
AF347015.26 -0.69 -0.65
鼻孔 -0.69 -0.65

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2向上 139 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应40 HELA 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应60 HELA 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应60 mcf10a 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild HRAS致癌特征 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
podar对Apaphostin的反应 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2靶向 40 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng正常老化 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征 20 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 908 914 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-135 2495 2501 1a HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-137 281 287 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-18 1055 1061 1a HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-181 1453 1460 1A,M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-182 2281 2288 1A,M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-186 2487 2493 M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-19 589 595 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-194 792 799 1A,M8 HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
MiR-200BC/429 67 73 1a HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 2441 2448 1A,M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-216 1447 1453 M8 HSA-MIR-216 uaaucucagcuggcaacugug
mir-218 482 489 1A,M8 HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-224 911 917 M8 HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-27 908 914 M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-3p 1492 1498 1a HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-30-5p 1170 1176 M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-330 2335 2341 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-369-3p 634 640 M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 1114 1120 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-376c 930 936 1a HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-381 1708年 1714年 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-382 1787年 1793年 M8 HSA-MIR-382 Gaaguuucgugguggauucg
mir-410 1116 1122 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-431 2372 2378 1a HSA-MIR-431 uguugcaggccguauga
mir-448 2108 2115 1A,M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-455 1304 1310 1a HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
mir-493-5p 2168 2175 1A,M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-495 2290 2296 M8 HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 1456 1462 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-544 230 237 1A,M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 2471 2477 M8 HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu
mir-96 2282 2288 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc