基因页:MBNL2
概括?
基因 | 10150 |
象征 | MBNL2 |
同义词 | mbll | mbll39 | pro2032 |
描述 | 像剪接调节器2 |
参考 | MIM:607327|HGNC:HGNC:16746|Ensembl:ENSG00000139793|HPRD:09543|Vega:Otthumg0000000017239 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q32.1 |
Pascal P值 | 0.137 |
Sherlock P值 | 0.605 |
胎儿β | -2.439 |
主持人 | 下丘脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16952071 | CHR13 | 97986447 | MBNL2 | 10150 | 0.18 | 顺式 | ||
RS7318821 | CHR13 | 97988346 | MBNL2 | 10150 | 0.18 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MBNL2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
clptm1l | 0.92 | 0.93 |
L3MBTL2 | 0.91 | 0.91 |
PGS1 | 0.91 | 0.90 |
COG8 | 0.91 | 0.89 |
VPS18 | 0.90 | 0.91 |
USP5 | 0.90 | 0.90 |
DGCR2 | 0.90 | 0.89 |
GDI1 | 0.89 | 0.88 |
DHX30 | 0.89 | 0.87 |
ARF1 | 0.89 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.71 |
AF347015.2 | -0.73 | -0.67 |
AF347015.8 | -0.73 | -0.71 |
AF347015.21 | -0.73 | -0.73 |
mt-cyb | -0.72 | -0.68 |
AF347015.33 | -0.71 | -0.67 |
higd1b | -0.70 | -0.67 |
AF347015.26 | -0.69 | -0.65 |
鼻孔 | -0.69 | -0.65 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2向上 | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应40 HELA | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应60 HELA | 46 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应60 mcf10a | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild HRAS致癌特征 | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VANASSE BCL2靶向 | 40 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON FOXP3目标 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng正常老化 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征 | 20 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-128 | 908 | 914 | 1a | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-135 | 2495 | 2501 | 1a | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
mir-137 | 281 | 287 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-18 | 1055 | 1061 | 1a | HSA-MIR-18A | uaagguggaugugcagaua |
HSA-MIR-18B | uaaggugcaucuagugcagua | ||||
mir-181 | 1453 | 1460 | 1A,M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-182 | 2281 | 2288 | 1A,M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-186 | 2487 | 2493 | M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu | ||||
mir-19 | 589 | 595 | M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga | ||||
HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
mir-194 | 792 | 799 | 1A,M8 | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
MiR-200BC/429 | 67 | 73 | 1a | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
mir-203.1 | 2441 | 2448 | 1A,M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag | ||||
mir-216 | 1447 | 1453 | M8 | HSA-MIR-216 | uaaucucagcuggcaacugug |
mir-218 | 482 | 489 | 1A,M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-224 | 911 | 917 | M8 | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
mir-27 | 908 | 914 | M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-30-3p | 1492 | 1498 | 1a | HSA-MIR-30A-3P | cuuucagucggauguugcagc |
HSA-MIR-30E-3P | cuuucagucggauguauacagc | ||||
mir-30-5p | 1170 | 1176 | M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-330 | 2335 | 2341 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-369-3p | 634 | 640 | M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu | ||||
HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu | ||||
mir-374 | 1114 | 1120 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
mir-376c | 930 | 936 | 1a | HSA-MIR-376C | aacauagaggaaauuccacg |
mir-381 | 1708年 | 1714年 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
mir-382 | 1787年 | 1793年 | M8 | HSA-MIR-382脑 | Gaaguuucgugguggauucg |
mir-410 | 1116 | 1122 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
mir-431 | 2372 | 2378 | 1a | HSA-MIR-431 | uguugcaggccguauga |
mir-448 | 2108 | 2115 | 1A,M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
mir-455 | 1304 | 1310 | 1a | HSA-MIR-455 | Uaugugccuuuggacuacaucg |
mir-493-5p | 2168 | 2175 | 1A,M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu | ||||
HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu | ||||
mir-495 | 2290 | 2296 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu | ||||
mir-496 | 1456 | 1462 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc | ||||
mir-544 | 230 | 237 | 1A,M8 | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 2471 | 2477 | M8 | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu | ||||
mir-96 | 2282 | 2288 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |