基因页：Trim28
概括？
| 基因 | 10155 |
| 象征 | Trim28 |
| 同义词 | kap1 | ppp1r157 | rnf96 | tf1b | tif1b |
| 描述 | 包含28的三方图案 |
| 参考 | MIM：601742|HGNC：HGNC：16384|Ensembl：ENSG00000130726|HPRD：03445|Vega：Otthumg00000183546 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.4 |
| Pascal P值 | 0.004 |
| Sherlock P值 | 0.652 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | Trim28 | 10155 | 0.09 | 反式 | ||
| RS7787830 | CHR7 | 98797019 | Trim28 | 10155 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CBX1 | CBX |hp1-beta |HP1HS-BETA |HP1HSBETA |M31 |mod1 |p25beta | Chromobox同源物1（HP1β同源果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 10562550|11336697 |
| CBX3 | Hech |HP1-gamma |HP1HS-GAMMA | Chromobox同源物3（HP1 Gamma同源物，果蝇） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 |
Biogrid | 10562550|11336697 |
| CBX5 | HP1 |HP1A | Chromobox同源物5（HP1 Alpha同源物，果蝇） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10562550|10938122 |11336697|12154074 |12411497 |
| CBX5 | HP1 |HP1A | Chromobox同源物5（HP1 Alpha同源物，果蝇） | - | HPRD | 10562550|12154074 |
| CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白（C/EBP），β | - | HPRD，Biogrid | 9742105|11711437 |
| CHD3 | Mi-2a |mi2-alpha |ZFH | 染色体群酶DNA结合蛋白3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| HLA-B | AS |HLA-B-7301 |HLA-B73 |hlab |HLAC |SPDA1 | 主要的组织相容性复合物，I类，B | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| NCOR1 | KIAA1047 |MGC104216 |n-cor |trac1 |HCIT529I10 |hn-cor | 核受体共抑制剂1 | 共纯化 | Biogrid | 11013263 |
| NR3C1 | GCCR |GCR |gr |grl | 核受体亚科3，C组，成员1（糖皮质激素受体） | - | HPRD，Biogrid | 9742105 |
| Sertad2 | MGC126688 |MGC126690 |sei-2 |Trip-BR2 | 包含2的serta域 | - | HPRD | 11331592 |
| setDB1 | eset |kg1t |KIAA0067 |KMT1E | 设定域，分叉1 | - | HPRD，Biogrid | 11959841 |
| SPG7 | 汽车|CMAR |FLJ37308 |MGC126331 |MGC126332 |PGN |SPG5C | 痉挛性截瘫7（纯和复杂的常染色体隐性） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| TFE3 | RCCP2 |tfea |Bhlhe33 | 转录因子与IGHM增强子3的结合3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| TNFRSF10D | CD264 |dcr2 |TRAILR4 |特伦德 | 肿瘤坏死因子受体超家族，成员10d，诱饵具有截短的死亡结构域 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| TRIM23 | ard1 |arfd1 |RNF46 | 含三方图案23 | 共纯化 | Biogrid | 11331580 |
| TRIM24 | PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 | 三方基序24 | - | HPRD，Biogrid | 12684500 |
| Trim28 | FLJ29029 |kap1 |RNF96 |TF1B |tif1b | 三方基序28 | - | HPRD，Biogrid | 12684500 |
| trim6 | RNF89 | 三方基序6 | 共纯化 | Biogrid | 11331580 |
| VHL | HRCA1 |RCA1 |VHL1 | von Hippel-Lindau肿瘤抑制剂 | 重构的复合物 | Biogrid | 12682018 |
| vim | FLJ36605 | 波形蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| ZNF10 | KOX1 | 锌指蛋白10 | - | HPRD，Biogrid | 9016654|10748030 |
| ZNF197 | D3S1363E |P18 |Vhlak |ZKSCAN9 |Znf166 |ZNF20 | 锌指蛋白197 | - | HPRD，Biogrid | 12682018 |
| ZNF382 | FLJ14686 |KS1 | 锌指蛋白382 | - | HPRD | 11154279 |
| ZNF74 | cos52 |Znf520 |ZFP520 | 锌指蛋白74 | - | HPRD，Biogrid | 12684500 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID E2F途径 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ATM路径 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CMYB途径 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P53调节途径 | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chemnitz对前列腺素E2的反应 | 146 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 受甲基化DN调节的Missiaglia | 122 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Appierto对Fenretinide DN的反应 | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 | 110 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindvall通过Tert Up永生 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杰克逊DNMT1靶向 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bacolod抗烷基化剂DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| nadella prkar1a靶向 | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 艾布拉姆森与艾尔互动 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |