基因页:ZNF197
概括?
基因 | 10168 |
象征 | ZNF197 |
同义词 | D3S1363E | P18 | VHLAK | ZKSCAN9 | ZNF166 | ZNF20 | ZSCAN41 |
描述 | 锌指蛋白197 |
参考 | HGNC:HGNC:12988|ENSEMBL:ENSG00000186448|HPRD:10322|Vega:Otthumg00000133089 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21 |
Pascal P值 | 0.032 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF197_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM179B | 0.91 | 0.89 |
TMEM30A | 0.91 | 0.92 |
sort1 | 0.90 | 0.89 |
MFSD6 | 0.90 | 0.89 |
arfgef2 | 0.90 | 0.88 |
MBNL1 | 0.90 | 0.87 |
NCOA7 | 0.90 | 0.89 |
SYT11 | 0.89 | 0.89 |
Wasl | 0.89 | 0.92 |
arl8b | 0.89 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rab34 | -0.46 | -0.51 |
Bcl7c | -0.45 | -0.50 |
C1orf61 | -0.45 | -0.54 |
DBI | -0.45 | -0.51 |
RP9P | -0.45 | -0.52 |
IL32 | -0.45 | -0.47 |
ST20 | -0.43 | -0.45 |
AC006276.2 | -0.43 | -0.42 |
EFEMP2 | -0.43 | -0.46 |
BTBD17 | -0.42 | -0.55 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |