基因页：ALG3
概括？
| 基因 | 10195 |
| 象征 | ALG3 |
| 同义词 | cdg1d | cdgs4 | cdgs6 | d16ertd36e | not56l | not56 | not |
| 描述 | Alg3，alpha-1,3-甘露糖基转移酶 |
| 参考 | MIM：608750|HGNC：HGNC：23056|ENSEMBL：ENSG00000214160|HPRD：03067|Vega：Otthumg00000156823 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q27.1 |
| Pascal P值 | 0.127 |
| Sherlock P值 | 0.78 |
| 胎儿β | 0.074 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24355091 | 3 | 185442994-185442995 | ALG3 | 0.001 | 4.314 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS843350 | CHR3 | 183946273 | ALG3 | 10195 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS1709620 | CHR3 | 183976693 | ALG3 | 10195 | 0 | 顺式 | ||
| RS1709620 | CHR3 | 183976693 | ALG3 | 10195 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| gorasp2 | 0.89 | 0.86 |
| ADPGK | 0.88 | 0.86 |
| C11orf49 | 0.88 | 0.84 |
| trpc4ap | 0.88 | 0.87 |
| MMS19 | 0.88 | 0.90 |
| NCSTN | 0.88 | 0.83 |
| RNF10 | 0.87 | 0.83 |
| VAC14 | 0.87 | 0.86 |
| kdelr1 | 0.87 | 0.88 |
| PSMF1 | 0.87 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.81 | -0.78 |
| MT-CO2 | -0.80 | -0.75 |
| AF347015.8 | -0.78 | -0.75 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.73 |
| AF347015.2 | -0.75 | -0.74 |
| mt-cyb | -0.75 | -0.72 |
| AF347015.27 | -0.74 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.72 |
| AF347015.18 | -0.73 | -0.78 |
| AF347015.26 | -0.72 | -0.71 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg n glycan生物合成 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| N Glycan前体Dolichol脂质的寡糖LLO的Reactome生物合成并转移到新生蛋白 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tomida转移 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 | 78 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN APC目标 | 77 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克莱因原发性积液淋巴瘤 | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤 | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu Crebbp目标 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |