Gene Page:PSME3

概括?
GeneID 10197
Symbol PSME3
同义词 HEL-S-283|Ki|PA28-gamma|PA28G|PA28gamma|REG-GAMMA
描述 蛋白酶体激活剂亚基3
参考 MIM:605129|HGNC:HGNC:9570|Ensembl:ENSG00000131467|HPRD:05500|Vega:OTTHUMG00000180654
Gene type protein-coding
地图位置 17q21
Pascal P值 0.188
Sherlock P值 0.369
Fetal beta -0.177
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:vanEijk_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 432 differentially methylated CpG sites corresponding to 391 unique transcripts between schizophrenia patients (n=260) and unaffected controls (n=250). 2
Expression 基因表达的荟萃分析 Pvalue: 1.812
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：3.5985

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg20760063 17 41277580 PSME3 7.082E-4 2.627 DMG:vanEijk_2014
cg20760063 17 41277580 PSME3 7.321E-4 2.258 DMG:vanEijk_2014


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0008538 proteasome activator activity IEA -
GO:0042802 identical protein binding 新闻学会 16169070
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process EXP 11285280
GO:0051436 negative regulation of ubiquitin-protein ligase activity during mitotic cell cycle EXP 15029244
GO:0051437 在有丝分裂细胞周期期间泛素 - 蛋白连接酶活性的正调控 EXP 12791267
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000502 蛋白酶体复合物 塔斯 8811196
去：0005829 cytosol IEA -
GO:0008537 proteasome activator complex IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ADAP1 Centa1 |GCS1L |P42IP4 ArfGAP with dual PH domains 1 两个杂交 BioGRID 16169070
ATP5B ATPMB | ATPSB | MGC5231 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, beta polypeptide 两个杂交 BioGRID 16169070
BBS2 BBS | MGC20703 Bardet-Biedl综合征2 两个杂交 BioGRID 16189514
FXR2 FMR1L2 脆弱的X心理迟缓，常染色体同源物2 两个杂交 BioGRID 16189514
HSPA5 BIP | FLJ26106 | GRP78 | MIF2 heat shock 70kDa protein 5 (glucose-regulated protein, 78kDa) 两个杂交 BioGRID 16169070
ITPKB IP3K |IP3K-B |IP3KB |PIG37 inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B 两个杂交 BioGRID 16189514
KIAA1267 DKFZp686P06109 | DKFZp727C091 | MGC102843 KIAA1267 两个杂交 BioGRID 16189514
MCC DKFZP762O1615 |FLJ38893 |FLJ46755 |MCC1 mutated in colorectal cancers 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
NUDT18 FLJ22494 nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 18 两个杂交 BioGRID 16189514
PSME3 Ki | PA28-gamma | PA28G | REG-GAMMA 蛋白酶体（Prosome，大型）激活剂亚基3（PA28伽马; ki） 两个杂交 BioGRID 16169070|16189514
RNPS1 E5.1 | MGC117332 RNA结合蛋白S1，富含丝氨酸的结构域 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
SERF2 4F5REL | FAM2C | FLJ20431 | FLJ37527 | FLJ38557 | H4F5rel | HsT17089 | MGC48826 small EDRK-rich factor 2 两个杂交 BioGRID 16189514
WDR25 MGC4645 WD重复域25 两个杂交 BioGRID 16189514
ZCCHC10 FLJ20094 zinc finger, CCHC domain containing 10 两个杂交 BioGRID 16189514


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG PROTEASOME 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ANTIGEN PROCESSING AND PRESENTATION 89 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIBETTA KDM5B TARGETS DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG DN的Elvidge缺氧 59 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A TARGETS UP 67 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAYBURD RESPONSE TO L663536 DN 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS MODERATELY DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PELLICCIOTTA HDAC IN ANTIGEN PRESENTATION DN 49 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG PROTEASOME GENE MODULE 49 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOYOTA TARGETS OF MIR34B AND MIR34C 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AGUIRRE PANCREATIC CANCER COPY NUMBER UP 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN IMMATURE TO MATURE B LYMPHOCYTE DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN ASPARAGINASE RESISTANCE ALL DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-15/16/195/424/497 992 998 m8 hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-186 1607年 1613年 m8 hsa-miR-186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
miR-30-5p 162 168 m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
miR-328 5 11 m8 HSA-MIR-328脑 CUGGCCCUCUCUGCCCUUCCGU
mir-378 184 190 1A hsa-miR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-490 249 255 m8 hsa-miR-490 CAACCUGGAGGACUCCAUGCUG
mir-495 58 65 1A,m8 hsa-miR-495脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir-496 1600 1606年 1A hsa-miR-496 AUUACAUGGCCAAUCUC
miR-7 1178 1184 1A hsa-miR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug