基因页:mphosph6
Summary?
基因ID | 10200 |
Symbol | mphosph6 |
同义词 | mpp | mpp-6 | mpp6 |
描述 | M期磷蛋白6 |
参考 | MIM:605500|HGNC:HGNC:7214|ENSEMBL:ENSG00000135698|HPRD:16111|Vega:Otthumg00000137632 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q23.3 |
Pascal P值 | 0.773 |
Sherlock P值 | 0.314 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 Frontal Cortex BA9 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.3604 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00816008 | 16 | 82203996 | mphosph6 | 1.01E-7 | 0.004 | 2.22E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6857639 | CHR4 | 13971853 | mphosph6 | 10200 | 0.04 | 反式 | ||
RS7202857 | 16 | 82160660 | mphosph6 | ENSG00000135698.5 | 5.81914E-7 | 0.02 | 43171 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2967327 | 16 | 82188657 | mphosph6 | ENSG00000135698.5 | 9.7272E-7 | 0.02 | 15174 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MPHOSPH6_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MAP4K2 | 0.78 | 0.79 |
FAM73B | 0.77 | 0.73 |
xylt2 | 0.76 | 0.81 |
SPOCK2 | 0.75 | 0.69 |
PLBD2 | 0.74 | 0.67 |
esyt3 | 0.74 | 0.67 |
DGKQ | 0.74 | 0.71 |
SLC6A7 | 0.73 | 0.66 |
ABCG4 | 0.73 | 0.62 |
galnt9 | 0.73 | 0.65 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C9orf46 | -0.41 | -0.49 |
RPL31 | -0.39 | -0.48 |
AC008073.1 | -0.39 | -0.42 |
RPS6 | -0.39 | -0.51 |
FAM36A | -0.38 | -0.41 |
FABP7 | -0.38 | -0.55 |
RPS3AP47 | -0.38 | -0.46 |
ifi44 | -0.38 | -0.46 |
TPT1 | -0.38 | -0.47 |
RPS20 | -0.37 | -0.55 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000087 | M丝分裂细胞周期的相 | 塔斯 | 8885239 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | cytoplasm | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AATF | CHE-1 | CHE1 | DED | 凋亡拮抗转录因子 | - | HPRD | 15231747 |
APLP1 | APLP | amyloid beta (A4) precursor-like protein 1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
ARHGAP18 | FLJ25728 | MGC126757 | MGC138145 | MacGAP | bA307O14.2 | Rho GTPase激活蛋白18 | - | HPRD | 15231747 |
C14orf1 | ERG28 |Net51 | chromosome 14 open reading frame 1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
C1orf103 | FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 | 染色体1开放阅读框103 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
C7orf64 | DKFZP564O0523 |DKFZP686D1651 |HSPC304 | 染色体7开放阅读框64 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
DNM2 | cmtdi1 |cmtdib |di-cmtb |dyn2 |dynii | Dynamin 2 | - | HPRD | 15231747 |
dynlrb1 | BITH | BLP | DNCL2A | DNLC2A | ROBLD1 | dynein, light chain, roadblock-type 1 | - | HPRD | 15231747 |
EIF3G | EIF3-P42 |EIF3S4 |eif3-delta |EIF3-P44 | 真核翻译起始因子3,亚基G | - | HPRD | 15231747 |
Exosc10 | PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 | 外泌体组件10 | - | HPRD | 15231747 |
GDF9 | - | 生长分化因子9 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
PARN | 担 | 聚(A)特异性核糖核酸酶(denenyylation核酸酶) | - | HPRD | 15231747 |
RPS20 | FLJ27451 |MGC102930 | 核糖体蛋白S20 | - | HPRD | 15231747 |
SKIV2L2 | DOB1 |KIAA0052 |MGC142069 |mtr4 |FSAP118 | 超级杀伤剂病毒活性2类样2(酿酒酵母) | - | HPRD | 15231747 |
Smarca4 | BAF190 | BRG1 | FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4 | - | HPRD | 15231747 |
SNX9 | MST155 |MSTP155 |SDP1 |SH3PX1 |SH3PXD3A |智慧 | 排序Nexin 9 | - | HPRD | 15231747 |
THOP1 | EP24.15 |mepd_human |MP78 |最佳 | thimet oligopeptidase 1 | - | HPRD | 15231747 |
TLE1 | ESG |ESG1 |grg1 | 分裂1(E(SP1)同源物,果蝇)的透明蛋白样增强剂 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白p53 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
ZHX1 | - | 锌的手指和同源蛋白酶1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |