Summary
基因ID 10200
Symbol mphosph6
同义词 mpp | mpp-6 | mpp6
描述 M期磷蛋白6
参考 MIM:605500|HGNC:HGNC:7214|ENSEMBL:ENSG00000135698|HPRD:16111|Vega:Otthumg00000137632
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q23.3
Pascal P值 0.773
Sherlock P值 0.314
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
Frontal Cortex BA9
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.3604

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00816008 16 82203996 mphosph6 1.01E-7 0.004 2.22E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6857639 CHR4 13971853 mphosph6 10200 0.04 反式
RS7202857 16 82160660 mphosph6 ENSG00000135698.5 5.81914E-7 0.02 43171 gtex_brain_putamen_basal
rs2967327 16 82188657 mphosph6 ENSG00000135698.5 9.7272E-7 0.02 15174 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MAP4K2 0.78 0.79
FAM73B 0.77 0.73
xylt2 0.76 0.81
SPOCK2 0.75 0.69
PLBD2 0.74 0.67
esyt3 0.74 0.67
DGKQ 0.74 0.71
SLC6A7 0.73 0.66
ABCG4 0.73 0.62
galnt9 0.73 0.65
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C9orf46 -0.41 -0.49
RPL31 -0.39 -0.48
AC008073.1 -0.39 -0.42
RPS6 -0.39 -0.51
FAM36A -0.38 -0.41
FABP7 -0.38 -0.55
RPS3AP47 -0.38 -0.46
ifi44 -0.38 -0.46
TPT1 -0.38 -0.47
RPS20 -0.37 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15231747
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000087 M丝分裂细胞周期的相 塔斯 8885239
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 cytoplasm IEA -

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
AATF CHE-1 | CHE1 | DED 凋亡拮抗转录因子 - HPRD 15231747
APLP1 APLP amyloid beta (A4) precursor-like protein 1 Two-hybrid Biogrid 16169070
ARHGAP18 FLJ25728 | MGC126757 | MGC138145 | MacGAP | bA307O14.2 Rho GTPase激活蛋白18 - HPRD 15231747
C14orf1 ERG28 |Net51 chromosome 14 open reading frame 1 Two-hybrid Biogrid 16169070
C1orf103 FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 染色体1开放阅读框103 Two-hybrid Biogrid 16169070
C7orf64 DKFZP564O0523 |DKFZP686D1651 |HSPC304 染色体7开放阅读框64 Two-hybrid Biogrid 16169070
DNM2 cmtdi1 |cmtdib |di-cmtb |dyn2 |dynii Dynamin 2 - HPRD 15231747
dynlrb1 BITH | BLP | DNCL2A | DNLC2A | ROBLD1 dynein, light chain, roadblock-type 1 - HPRD 15231747
EIF3G EIF3-P42 |EIF3S4 |eif3-delta |EIF3-P44 真核翻译起始因子3,亚基G - HPRD 15231747
Exosc10 PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 外泌体组件10 - HPRD 15231747
GDF9 - 生长分化因子9 Two-hybrid Biogrid 16169070
PARN 聚(A)特异性核糖核酸酶(denenyylation核酸酶) - HPRD 15231747
RPS20 FLJ27451 |MGC102930 核糖体蛋白S20 - HPRD 15231747
SKIV2L2 DOB1 |KIAA0052 |MGC142069 |mtr4 |FSAP118 超级杀伤剂病毒活性2类样2(酿酒酵母) - HPRD 15231747
Smarca4 BAF190 | BRG1 | FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4 - HPRD 15231747
SNX9 MST155 |MSTP155 |SDP1 |SH3PX1 |SH3PXD3A |智慧 排序Nexin 9 - HPRD 15231747
THOP1 EP24.15 |mepd_human |MP78 |最佳 thimet oligopeptidase 1 - HPRD 15231747
TLE1 ESG |ESG1 |grg1 分裂1(E(SP1)同源物,果蝇)的透明蛋白样增强剂 Two-hybrid Biogrid 16169070
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白p53 Two-hybrid Biogrid 16169070
UNC119 HRG4 UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) Two-hybrid Biogrid 16169070
ZHX1 - 锌的手指和同源蛋白酶1 Two-hybrid Biogrid 16169070


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG RNA降解 59 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多恩乳腺癌课程 72 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tien肠益生菌24小时 557 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Provenzani转移 194 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮增强 293 179 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和血清剥夺DN的反应 84 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与基础 330 217 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标 380 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌 358 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江VHL目标 138 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
外邦紫外线响应集群D5 39 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
外邦紫外线高剂量DN 312 203 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sakai慢性肝炎与肝癌 83 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Karlsson TGFB1靶向 127 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 All SZGR 2.0 genes in this pathway