基因页面:TRIM13
总结吗?
GeneID | 10206年 |
象征 | TRIM13 |
同义词 | 汽车| DLEU5 | LEU5 | RFP2 | RNF77 |
描述 | 三方主题包含13 |
参考 | MIM: 605661|HGNC: HGNC: 9976|运用:ENSG00000204977|HPRD: 10414|织女:OTTHUMG00000016926 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 13 q14 |
帕斯卡假定值 | 0.047 |
夏洛克假定值 | 0.668 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs13005317 | chr2 | 34580511 | TRIM13 | 10206年 | 0.11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRIM13_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004871 | 信号传感器活动 | 小鬼 | 12761501 | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0009653 | 解剖结构形态发生 | 助教 | 9599022 | |
去:0043123 | 积极的监管I-kappaB激酶/ NF-kappaB级联 | 小鬼 | 12761501 | |
去:0045786 | 负调控细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005813 | 中心体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
通过CD40 DN HOLLMANN细胞凋亡 | 267年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN BASAKI YBX1目标 | 384年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王食道癌和正常的DN | 101年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3滑落紫外线反应 | 309年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TCGA胶质母细胞瘤拷贝数DN | 31日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
与13 q14 HASLINGER B CLL删除 | 24 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
张对斑蝥素 | 19 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
外邦人紫外线高剂量DN | 312年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
外邦人响应集群D3 | 61年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
OUILLETTE CLL 13 q14删除DN | 60 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄达沙替尼耐DN | 69年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应中间 | 98年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 181 | 2330年 | 2336年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
mir - 335 | 2684年 | 2690年 | m8 | hsa - mir - 335大脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUGU |
mir - 376 | 2567年 | 2574年 | 1、m8 | hsa - mir - 376 a | AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU |
hsa - mir - 376 b | AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU | ||||
mir - 378 | 2312年 | 2319年 | 1、m8 | hsa - mir - 378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |
mir - 452 | 2124年 | 2131年 | 1、m8 | hsa - mir - 452 | UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC |