基因页:DCAF7
概括?
基因 | 10238 |
象征 | DCAF7 |
同义词 | AN11 | HAN11 | SWAN-1 | WDR68 |
描述 | DDB1和CUL4相关因子7 |
参考 | MIM:605973|HGNC:HGNC:30915|ENSEMBL:ENSG00000136485|HPRD:09340|Vega:Otthumg00000178902 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q23.3 |
Pascal P值 | 0.02 |
Sherlock P值 | 0.645 |
胎儿β | 0.522 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CH.17.1629120F | 17 | 61640870 | DCAF7 | 1.73E-6 | -1.743 | 0.008 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6793958 | CHR3 | 17853055 | DCAF7 | 10238 | 0.03 | 反式 | ||
RS16915112 | CHR8 | 51538881 | DCAF7 | 10238 | 0.1 | 反式 | ||
RS17124153 | CHR14 | 52014010 | DCAF7 | 10238 | 0.12 | 反式 | ||
RS2304127 | CHR19 | 56896573 | DCAF7 | 10238 | 0.2 | 反式 | ||
RS2822799 | CHR21 | 15958167 | DCAF7 | 10238 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DCAF7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
yap1 | 0.82 | 0.75 |
palld | 0.82 | 0.75 |
Sox9 | 0.79 | 0.66 |
BMP7 | 0.79 | 0.79 |
NR2E1 | 0.79 | 0.75 |
M6PRBP1 | 0.77 | 0.72 |
9月2日 | 0.77 | 0.72 |
Notch2 | 0.77 | 0.74 |
MSI2 | 0.76 | 0.71 |
ZFP36L1 | 0.76 | 0.71 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC26A4 | -0.32 | -0.37 |
FBXW7 | -0.27 | -0.24 |
Fabp3 | -0.26 | -0.18 |
LRFN2 | -0.26 | -0.23 |
KCNV1 | -0.25 | -0.20 |
RTN4RL1 | -0.25 | -0.19 |
MEF2C | -0.25 | -0.22 |
FAM19A1 | -0.25 | -0.22 |
ARHGAP20 | -0.24 | -0.18 |
HS3ST2 | -0.24 | -0.19 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌高复发 | 49 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kannan TP53目标 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌簇5 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |