概括
基因 10238
象征 DCAF7
同义词 AN11 | HAN11 | SWAN-1 | WDR68
描述 DDB1和CUL4相关因子7
参考 MIM:605973|HGNC:HGNC:30915|ENSEMBL:ENSG00000136485|HPRD:09340|Vega:Otthumg00000178902
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q23.3
Pascal P值 0.02
Sherlock P值 0.645
胎儿β 0.522
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CH.17.1629120F 17 61640870 DCAF7 1.73E-6 -1.743 0.008 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6793958 CHR3 17853055 DCAF7 10238 0.03 反式
RS16915112 CHR8 51538881 DCAF7 10238 0.1 反式
RS17124153 CHR14 52014010 DCAF7 10238 0.12 反式
RS2304127 CHR19 56896573 DCAF7 10238 0.2 反式
RS2822799 CHR21 15958167 DCAF7 10238 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
yap1 0.82 0.75
palld 0.82 0.75
Sox9 0.79 0.66
BMP7 0.79 0.79
NR2E1 0.79 0.75
M6PRBP1 0.77 0.72
9月2日 0.77 0.72
Notch2 0.77 0.74
MSI2 0.76 0.71
ZFP36L1 0.76 0.71
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC26A4 -0.32 -0.37
FBXW7 -0.27 -0.24
Fabp3 -0.26 -0.18
LRFN2 -0.26 -0.23
KCNV1 -0.25 -0.20
RTN4RL1 -0.25 -0.19
MEF2C -0.25 -0.22
FAM19A1 -0.25 -0.22
ARHGAP20 -0.24 -0.18
HS3ST2 -0.24 -0.19

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌高复发 49 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kannan TP53目标 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇5 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因