基因页:SLC17A2
概括?
基因 | 10246 |
象征 | SLC17A2 |
同义词 | NPT3 |
描述 | Solute Carrier家族17成员2 |
参考 | MIM:611049|HGNC:HGNC:10930|ENSEMBL:ENSG00000112337|HPRD:10232|Vega:Otthumg0000000014413 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 1.827E-10 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC17A2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MRPL47 | 0.82 | 0.82 |
commd10 | 0.81 | 0.77 |
C18orf32 | 0.79 | 0.76 |
MRPL13 | 0.79 | 0.77 |
CCNH | 0.79 | 0.78 |
PDCD10 | 0.78 | 0.80 |
ATP5C1 | 0.78 | 0.74 |
Cryzl1 | 0.77 | 0.76 |
MRPL1 | 0.76 | 0.75 |
suclg1 | 0.76 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tenc1 | -0.46 | -0.53 |
DOCK6 | -0.45 | -0.50 |
mtss1l | -0.43 | -0.48 |
myh9 | -0.42 | -0.40 |
GP1BA | -0.42 | -0.45 |
FAM38A | -0.42 | -0.47 |
ITPR3 | -0.41 | -0.43 |
NOS3 | -0.41 | -0.49 |
C9orf131 | -0.41 | -0.49 |
工程 | -0.41 | -0.45 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005436 | 钠:磷酸盐分类蛋白活性 | 塔斯 | 9149941 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
GO:0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
GO:0031402 | 钠离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006814 | 钠离子运输 | 塔斯 | 9149941 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0006796 | 磷酸盐代谢过程 | 塔斯 | 9149941 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 9149941 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9149941 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |