概括
基因 10252
象征 Spry1
同义词 Hspry1
描述 发芽的RTK信号拮抗剂1
参考 MIM:602465|HGNC:HGNC:11269|ENSEMBL:ENSG00000164056|HPRD:06782|Vega:Otthumg00000133071
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q28.1
Pascal P值 0.247
Sherlock P值 0.294
胎儿β 0.44
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 3
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00882832 4 124317983 Spry1 -0.024 0.35 DMG:Nishioka_2013
CG09720833 4 124427045 Spry1 1.36E-10 -0.019 4.9e-7 DMG:JAFFE_2016
CG00148825 4 124427195 Spry1 1.3e-8 -0.016 5.2e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPL13A 0.97 0.93
RPS11P5 0.96 0.95
EIF3F 0.96 0.94
RPLP0P3 0.96 0.98
RPL10 0.96 0.93
EIF3L 0.96 0.89
tut1 0.96 0.94
rps19p3 0.95 0.93
SSR2 0.95 0.94
rps3p3 0.95 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.65 -0.72
FBXO2 -0.64 -0.69
AIFM3 -0.63 -0.69
C5orf53 -0.63 -0.63
LDHD -0.62 -0.68
AF347015.27 -0.62 -0.78
tinagl1 -0.61 -0.72
aldoc -0.61 -0.67
克鲁 -0.61 -0.68
pth1r -0.61 -0.64

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg jak stat信号通路 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Spry途径 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome EGFR下调 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN 67 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇1 51 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 DN 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
整合素信号传导 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴vs血液 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌bracx 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时DN 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
转移期间的clasper淋巴管 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matthews AP1目标 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集10 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
val aml与evi1 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因