概括
基因 10253
象征 spry2
同义词 igan3 | hspry2
描述 发芽的RTK信号拮抗剂2
参考 MIM:602466|HGNC:HGNC:11270|ENSEMBL:ENSG00000136158|HPRD:03916|Vega:Otthumg0000000017140
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q31.1
Pascal P值 0.613
Sherlock P值 0.472
胎儿β -0.452

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC25A39 0.88 0.88
Sharpin 0.86 0.86
GPS1 0.86 0.85
vkorc1 0.85 0.81
GSTP1 0.85 0.81
SH3BGRL3 0.84 0.84
应付 0.84 0.85
COQ4 0.83 0.82
GNB2 0.82 0.78
MRPS2 0.81 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.52 -0.57
AF347015.8 -0.51 -0.55
mt-cyb -0.50 -0.55
AF347015.31 -0.50 -0.53
MT-CO2 -0.50 -0.53
MT-ATP8 -0.49 -0.60
AF347015.33 -0.49 -0.53
AF347015.2 -0.48 -0.54
AF347015.15 -0.47 -0.52
AF347015.26 -0.46 -0.52

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009966 信号转导调节 IEA -
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 9458049
去:0009887 器官形态发生 塔斯 9458049
去:0007605 声音的感官感知 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
GO:0042472 内耳形态发生 IEA -
GO:0048754 管的分支形态发生 IEA -
GO:0030324 肺发展 IEA -
GO:0043407 MAP激酶活性的负调控 IEA -
GO:0045165 细胞命运承诺 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 12593796
去:0005874 微管 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005886 质膜 经验 15962011
去:0005886 质膜 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Adamtsl4 TSRC1 类似Adamts的4 两个杂交 Biogrid 16189514
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 - HPRD,Biogrid 11053437|12234920
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 C-CBL与Hspry2相互作用。这种相互作用是基于未指定物种和人类HSPRY2的C-CBL之间的相互作用进行建模的。 绑定 12234920
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 SPRY2与C-CBL相互作用。 绑定 11053437
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 HSPRY2与C-CBL相互作用。 绑定 12815057
CBLB DKFZP686J10223 |DKFZP779A0729 |DKFZP779F1443 |FLJ36865 |FLJ41152 |NBLA00127 |RNF56 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列B SPRY2与CBL-B相互作用。 绑定 11053437
CBLC CBL-3 |CBL-SL |RNF57 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列C - HPRD 12234920
GPRIN2 grin2 |KIAA0514 |MGC15171 G蛋白调控神经突生长2 两个杂交 Biogrid 16189514
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 10940627|12402043
KRTAP4-12 kap4.12 |KRTAP4.12 角蛋白相关蛋白4-12 两个杂交 Biogrid 16189514
PLSCR1 mmtra1b 磷脂cramblase 1 两个杂交 Biogrid 16189514
RAF1 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12717443
spryd5 MGC10977 |TRIM51 包含5的Spry域 两个杂交 Biogrid 16189514
traf2 MGC:45012 |陷阱|陷阱3 TNF受体相关因子2 两个杂交 Biogrid 16189514


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg jak stat信号通路 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Spry途径 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1内部化途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FGF途径 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGF信号的Reactome Spry调节 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR信号的Reactome负调节 37 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome EGFR下调 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dawson TCL1中的甲基化 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MS 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HNE和H2O2的Weigel氧化应激 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee SP4胸腺细胞 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 68 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Winzen通过KHSRP退化 100 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 494 500 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 494 500 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 382 388 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-21 236 243 1A,M8 HSA-MIR-21 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-23 458 465 1A,M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-27 382 389 1A,M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-323 458 464 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-326 337 343 1a HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-369-3p 428 434 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 428 434 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-378 10 16 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-381 359 365 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu