基因页:spry2
概括?
基因 | 10253 |
象征 | spry2 |
同义词 | igan3 | hspry2 |
描述 | 发芽的RTK信号拮抗剂2 |
参考 | MIM:602466|HGNC:HGNC:11270|ENSEMBL:ENSG00000136158|HPRD:03916|Vega:Otthumg0000000017140 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q31.1 |
Pascal P值 | 0.613 |
Sherlock P值 | 0.472 |
胎儿β | -0.452 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SPRY2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC25A39 | 0.88 | 0.88 |
Sharpin | 0.86 | 0.86 |
GPS1 | 0.86 | 0.85 |
vkorc1 | 0.85 | 0.81 |
GSTP1 | 0.85 | 0.81 |
SH3BGRL3 | 0.84 | 0.84 |
应付 | 0.84 | 0.85 |
COQ4 | 0.83 | 0.82 |
GNB2 | 0.82 | 0.78 |
MRPS2 | 0.81 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.52 | -0.57 |
AF347015.8 | -0.51 | -0.55 |
mt-cyb | -0.50 | -0.55 |
AF347015.31 | -0.50 | -0.53 |
MT-CO2 | -0.50 | -0.53 |
MT-ATP8 | -0.49 | -0.60 |
AF347015.33 | -0.49 | -0.53 |
AF347015.2 | -0.48 | -0.54 |
AF347015.15 | -0.47 | -0.52 |
AF347015.26 | -0.46 | -0.52 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009966 | 信号转导调节 | IEA | - | |
去:0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 9458049 | |
去:0009887 | 器官形态发生 | 塔斯 | 9458049 | |
去:0007605 | 声音的感官感知 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
GO:0042472 | 内耳形态发生 | IEA | - | |
GO:0048754 | 管的分支形态发生 | IEA | - | |
GO:0030324 | 肺发展 | IEA | - | |
GO:0043407 | MAP激酶活性的负调控 | IEA | - | |
GO:0045165 | 细胞命运承诺 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 12593796 | |
去:0005874 | 微管 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 经验 | 15962011 | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Adamtsl4 | TSRC1 | 类似Adamts的4 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | - | HPRD,Biogrid | 11053437|12234920 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | C-CBL与Hspry2相互作用。这种相互作用是基于未指定物种和人类HSPRY2的C-CBL之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12234920 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | SPRY2与C-CBL相互作用。 | 绑定 | 11053437 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | HSPRY2与C-CBL相互作用。 | 绑定 | 12815057 |
CBLB | DKFZP686J10223 |DKFZP779A0729 |DKFZP779F1443 |FLJ36865 |FLJ41152 |NBLA00127 |RNF56 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列B | SPRY2与CBL-B相互作用。 | 绑定 | 11053437 |
CBLC | CBL-3 |CBL-SL |RNF57 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列C | - | HPRD | 12234920 |
GPRIN2 | grin2 |KIAA0514 |MGC15171 | G蛋白调控神经突生长2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 10940627|12402043 |
KRTAP4-12 | kap4.12 |KRTAP4.12 | 角蛋白相关蛋白4-12 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
PLSCR1 | mmtra1b | 磷脂cramblase 1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
RAF1 | 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf | V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12717443 |
spryd5 | MGC10977 |TRIM51 | 包含5的Spry域 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
traf2 | MGC:45012 |陷阱|陷阱3 | TNF受体相关因子2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Spry途径 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1内部化途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FGF途径 | 55 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGF信号的Reactome Spry调节 | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR信号的Reactome负调节 | 37 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome EGFR下调 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 | 79 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee神经Crest干细胞DN | 118 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dawson TCL1中的甲基化 | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 156 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 110 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MS | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HNE和H2O2的Weigel氧化应激 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索毛毛细胞白血病DN | 80 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee SP4胸腺细胞 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN | 20 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 | 68 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 494 | 500 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 494 | 500 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-128 | 382 | 388 | 1a | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-21 | 236 | 243 | 1A,M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagacugauguuga |
HSA-MIR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag | ||||
mir-23 | 458 | 465 | 1A,M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-27 | 382 | 389 | 1A,M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-323 | 458 | 464 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
mir-326 | 337 | 343 | 1a | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
mir-369-3p | 428 | 434 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 428 | 434 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
mir-378 | 10 | 16 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-381 | 359 | 365 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |