基因页：Stam2
概括？
| 基因 | 10254 |
| 象征 | Stam2 |
| 同义词 | HBP | Stam2a | Stam2b |
| 描述 | 信号转导适配器分子2 |
| 参考 | MIM：606244|HGNC：HGNC：11358|ENSEMBL：ENSG00000115145|HPRD：05876|Vega：Otthumg00000131885 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q23.3 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| 胎儿β | 0.467 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG09558414 | 2 | 153032159 | Stam2 | 1.83E-9 | -0.014 | 1.57E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11124283 | CHR2 | 32767095 | Stam2 | 10254 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BBS1 | 0.85 | 0.86 |
| pygo2 | 0.85 | 0.87 |
| ptprf | 0.83 | 0.87 |
| KIAA1539 | 0.83 | 0.87 |
| GPR135 | 0.83 | 0.86 |
| lztr1 | 0.82 | 0.88 |
| NLGN3 | 0.82 | 0.82 |
| mogs | 0.82 | 0.85 |
| atxn2 | 0.82 | 0.85 |
| Zmym3 | 0.82 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.78 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.72 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.65 | -0.66 |
| AF347015.27 | -0.65 | -0.67 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.68 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.65 |
| higd1b | -0.64 | -0.66 |
| ifi27 | -0.63 | -0.61 |
| FXYD1 | -0.62 | -0.61 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006886 | 细胞内蛋白转运 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 10567358|12218189|15962011 |
|
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL2 1 Pathway | 55 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome EGFR下调 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组内体分选复合物需要运输escrt | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jiang Tip30目标 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-218 | 119 | 126 | 1A，M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-22 | 215 | 221 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
| mir-31 | 555 | 561 | 1a | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |