基因页：ABCC4
Summary？
| 基因 | 10257 |
| 象征 | ABCC4 |
| 同义词 | Moat-B | Moatb | Mrp4 |
| 描述 | ATP绑定盒子亚家族C成员4 |
| Reference | MIM：605250|HGNC:HGNC:55|ENSEMBL：ENSG00000125257|HPRD：05583|Vega：Otthumg0000000017216 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13q32 |
| Pascal P值 | 0.498 |
| 胎儿β | 0.716 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 梭子基底神经节 Myers' cis & trans |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:GWASdb | Genome-wide Association Studies | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS12252439 | Chr10 | 23107271 | ABCC4 | 10257 | 0.14 | 反式 | ||
| RS1933665 | 13 | 96007919 | ABCC4 | ENSG00000125257.9 | 2.79275E-6 | 0.04 | -54232 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NFE2L2 | 0.86 | 0.88 |
| CYP27A1 | 0.84 | 0.91 |
| anxa4 | 0.83 | 0.86 |
| hadhb | 0.82 | 0.89 |
| SLC35D2 | 0.82 | 0.86 |
| gramd3 | 0.81 | 0.89 |
| htra1 | 0.81 | 0.87 |
| CD9 | 0.81 | 0.85 |
| CSRP1 | 0.80 | 0.88 |
| SLC9A9 | 0.80 | 0.80 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DPF1 | -0.72 | -0.73 |
| 3月4日 | -0.71 | -0.72 |
| ZNF821 | -0.71 | -0.70 |
| mpp3 | -0.70 | -0.70 |
| KIAA1543 | -0.70 | -0.70 |
| TNRC4 | -0.69 | -0.70 |
| CHD3 | -0.69 | -0.69 |
| KIAA1949 | -0.69 | -0.62 |
| nkiras2 | -0.69 | -0.67 |
| TRIM46 | -0.69 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | nucleotide binding | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0005254 | 氯化物通道活性 | IEA | - | |
| GO：0016887 | ATPase activity | IEA | - | |
| GO：0016404 | 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (NAD+) activity | nas | 7557451 | |
| GO：0042626 | ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008150 | biological_process | nd | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005575 | cellular_component | nd | - | |
| 去：0005624 | 膜分数 | 艾达 | 15297306 | |
| 去：0016020 | membrane | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 15297306 | |
| GO:0031088 | 血小板致密颗粒膜 | 艾达 | 15297306 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124.1 | 262 | 269 | 1A，M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-124/506 | 261 | 268 | 1A，M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124brain | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| miR-125/351 | 377 | 383 | 1a | hsa-miR-125bbrain | ucccugagacccuaacuuguga |
| hsa-miR-125abrain | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
| miR-140 | 1103 | 1110 | 1A，M8 | HSA-MIR-140brain | AGUGGUUUUACCCUAUGGUAG |
| mir-26 | 391 | 398 | 1A，M8 | HSA-MIR-26Abrain | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir-500 | 222 | 228 | M8 | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |
| mir-539 | 653 | 659 | 1a | HSA-MIR-539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |