基因页：IRX5
概括？
| 基因 | 10265 |
| 象征 | IRX5 |
| 同义词 | HMMS | IRX-2A | IRXB2 |
| 描述 | iroquois homeobox 5 |
| 参考 | MIM：606195|HGNC：HGNC：14361|ENSEMBL：ENSG00000176842|HPRD：08395|Vega：Otthumg00000133201 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16Q12.2 |
| Pascal P值 | 0.404 |
| 胎儿β | -0.072 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18683774 | 16 | 54964820 | IRX5 | 4.918E-4 | -0.235 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
| CG04153740 | 16 | 54971018 | IRX5 | 1.24e-10 | -0.013 | 4.83e-7 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG03482123 | 16 | 54964029 | IRX5 | 2.19e-9 | -0.02 | 1.7E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NPM1 | 0.94 | 0.91 |
| EIF3M | 0.94 | 0.91 |
| CCT2 | 0.93 | 0.90 |
| IGBP1 | 0.93 | 0.91 |
| polr1d | 0.92 | 0.87 |
| EIF3E | 0.92 | 0.88 |
| DCAF13 | 0.92 | 0.87 |
| RBM34 | 0.92 | 0.86 |
| DPH5 | 0.91 | 0.85 |
| haus1 | 0.91 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HLA-F | -0.61 | -0.73 |
| tinagl1 | -0.61 | -0.77 |
| apol1 | -0.61 | -0.76 |
| SLC9A3R2 | -0.60 | -0.63 |
| ATP10A | -0.60 | -0.72 |
| AF347015.33 | -0.59 | -0.74 |
| AIFM3 | -0.59 | -0.70 |
| ST6GALNAC1 | -0.58 | -0.71 |
| MT-CO2 | -0.58 | -0.72 |
| apol3 | -0.58 | -0.73 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌簇7 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老肌肉DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sharma毛囊星形胶质细胞瘤位置DN | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄达沙替尼抵抗DN | 69 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |