基因页:SAP18
概括?
基因 | 10284 |
象征 | SAP18 |
同义词 | 2HOR0202 | SAP18P |
描述 | SIN3A相关蛋白18KDA |
参考 | MIM:602949|HGNC:HGNC:10530|Ensembl:ENSG00000150459|HPRD:04256|Vega:Otthumg0000000016535 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q12.11 |
Pascal P值 | 0.902 |
Sherlock P值 | 0.094 |
胎儿β | -0.838 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13369624 | 13 | 21714458 | SAP18 | 7.86e-10 | -0.017 | 1.03E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4760510 | CHR12 | 93351595 | SAP18 | 10284 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SAP18_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003714 | 转录CorePressor活性 | 塔斯 | 9150135 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9150135|17353931 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006357 | 调节RNA聚合酶II启动子的转录 | 塔斯 | 9150135 | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000118 | 组蛋白脱乙酰基酶复合物 | 塔斯 | 9150135 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ATP5L | ATP5JG | ATP合酶,H+转运,线粒体F0复合物,亚基G | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
C6ORF211 | DKFZP566I174 |FLJ12910 | 染色体6开放阅读框211 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ddost | Age-R1 |KIAA0115 |MGC2191 |OK/SW-CL.45 |Ost |Ost48 |WBP1 | 多甲基 - 二磷酸糖蛋白糖基转移酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ddx3x | DBX |ddx14 |ddx3 |HLP2 | 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽3,X连接 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
EIF3E | EIF3-P48 |EIF3S6 |int6 |EIF3-P46 | 真核翻译起始因子3,亚基E | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | - | HPRD | 9150135 |
KIAA1279 | DKFZP586B0923 |KBP |TTC20 | KIAA1279 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
NOL12 | FLJ34609 |MGC3731 |NOP25 |DJ37E16.7 | 核仁蛋白12 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
NSF | SKD2 | N-乙基马来酰亚胺敏感因子 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
POL2 | DPE2 | 聚合酶(指向DNA),Epsilon 2(P59亚基) | 两个杂交 | Biogrid | 11872158 |
RGS10 | - | G蛋白信号传导的调节剂10 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPN2 | ribiir |rpn-ii |rpnii |SWP1 | 核蛋白II | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS3A | fte1 |mftl |MGC23240 | 核糖体蛋白S3A | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) | 重构的复合物 | Biogrid | 9651585 |
苏富 | Pro1280 |Sufuh |sufuxl | 融合同源物(果蝇)的抑制剂 | - | HPRD,Biogrid | 11960000|14611647 |
tada3l | ADA3 |FLJ20221 |FLJ21329 |hada3 | 转录适配器3(NGG1同源性,酵母)类似 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
YARS | cmtdic |Tyrrs |yrs |yts | 酪酶tRNA合成酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID SMAD2 3核途径 | 82 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HDAC Classi途径 | 66 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID端粒酶途径 | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID刺猬Gli途径 | 48 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 8Q24 DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1信号传导DN | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞编号小与巨大的DN | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
用VH3 21 DN的FAELT B CLL | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
takao对UVB辐射的响应 | 86 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C0的反应 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G1 | 67 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林黑色素瘤副本编号DN | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yuan Znf143合作伙伴 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |