概括
基因 10284
象征 SAP18
同义词 2HOR0202 | SAP18P
描述 SIN3A相关蛋白18KDA
参考 MIM:602949|HGNC:HGNC:10530|Ensembl:ENSG00000150459|HPRD:04256|Vega:Otthumg0000000016535
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12.11
Pascal P值 0.902
Sherlock P值 0.094
胎儿β -0.838
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13369624 13 21714458 SAP18 7.86e-10 -0.017 1.03E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4760510 CHR12 93351595 SAP18 10284 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003714 转录CorePressor活性 塔斯 9150135
去:0005515 蛋白质结合 IPI 9150135|17353931
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 9150135
去:0006350 转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000118 组蛋白脱乙酰基酶复合物 塔斯 9150135

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ATP5L ATP5JG ATP合酶,H+转运,线粒体F0复合物,亚基G 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
C6ORF211 DKFZP566I174 |FLJ12910 染色体6开放阅读框211 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ddost Age-R1 |KIAA0115 |MGC2191 |OK/SW-CL.45 |Ost |Ost48 |WBP1 多甲基 - 二磷酸糖蛋白糖基转移酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ddx3x DBX |ddx14 |ddx3 |HLP2 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽3,X连接 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
EIF3E EIF3-P48 |EIF3S6 |int6 |EIF3-P46 真核翻译起始因子3,亚基E 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
HDAC1 DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 - HPRD 9150135
KIAA1279 DKFZP586B0923 |KBP |TTC20 KIAA1279 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
NOL12 FLJ34609 |MGC3731 |NOP25 |DJ37E16.7 核仁蛋白12 两个杂交 Biogrid 16169070
NSF SKD2 N-乙基马来酰亚胺敏感因子 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
POL2 DPE2 聚合酶(指向DNA),Epsilon 2(P59亚基) 两个杂交 Biogrid 11872158
RGS10 - G蛋白信号传导的调节剂10 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPN2 ribiir |rpn-ii |rpnii |SWP1 核蛋白II 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS3A fte1 |mftl |MGC23240 核糖体蛋白S3A 两个杂交 Biogrid 16169070
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) 重构的复合物 Biogrid 9651585
苏富 Pro1280 |Sufuh |sufuxl 融合同源物(果蝇)的抑制剂 - HPRD,Biogrid 11960000|14611647
tada3l ADA3 |FLJ20221 |FLJ21329 |hada3 转录适配器3(NGG1同源性,酵母)类似 两个杂交 Biogrid 16169070
YARS cmtdic |Tyrrs |yrs |yts 酪酶tRNA合成酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID SMAD2 3核途径 82 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC Classi途径 66 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID端粒酶途径 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID刺猬Gli途径 48 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heidenblad Amplicon 8Q24 DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1信号传导DN 35 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞编号小与巨大的DN 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
用VH3 21 DN的FAELT B CLL 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
takao对UVB辐射的响应 86 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C0的反应 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G1 67 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤副本编号DN 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yuan Znf143合作伙伴 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因