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总结吗?

GeneID	10285年
象征	SMNDC1
同义词	SMNR \| SPF30 \| TDRD16C
描述	运动神经元生存域包含1
参考	MIM: 603519\|HGNC: HGNC: 16900\|HPRD: 04627\|
基因型	蛋白质编码
地图上的位置	10 q23处
帕斯卡假定值	0.447
夏洛克假定值	0.863
胎儿β	0.506
DMG	1(#研究)
eGene	迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源

基因集名称	基因的方法设置	描述	信息
简历:PGCnp	全基因组关联研究	GWAS
DMG: Jaffe_2016	全基因组DNA甲基化分析	这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。	1

部分即遗传学和表观遗传学注释

不同甲基化基因

探针	染色体	位置	最近的基因	P (dis)	β(dis)	罗斯福(dis)	研究
cg21872391	10	112064057	SMNDC1	1.23 e-8	-0.013	5 e-6	DMG: Jaffe_2016

eQTL注释

SNP ID	染色体	位置	eGene	基因Entrez ID	qvalue	eQTL类型
rs7629431	chr3	189336841	SMNDC1	10285年	0.14	反式
rs4491879	chr3	189373908	SMNDC1	10285年	0.03	反式
rs4505678	chr3	189374356	SMNDC1	10285年	0.06	反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因	皮尔森的相关性	斯皮尔曼的相关性
PCIF1	0.96	0.94
ZNF574	0.95	0.96
ZC3H3	0.95	0.95
NUP62	0.95	0.95
GEMIN4	0.95	0.94
ZNF319	0.94	0.94
MAPK7	0.94	0.92
NUP188	0.94	0.94
ZNF835	0.94	0.96
USP21	0.94	0.94

十大负面中的基因
基因	皮尔森的相关性	斯皮尔曼的相关性
C5orf53	-0.71	-0.79
AF347015.31	-0.70	-0.87
MT-CO2	-0.69	-0.88
AF347015.27	-0.69	-0.86
AF347015.33	-0.67	-0.84
S100B	-0.67	-0.81
AF347015.8	-0.66	-0.86
MT-CYB	-0.66	-0.83
FXYD1	-0.65	-0.81
IFI27	-0.65	-0.78

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员	别名B	官方全名B	实验	源	PubMed ID
CDK5RAP3	C53 \| HSF-27 \| IC53 \| LZAP \| MST016 \|好吧/ SW-cl.114	CDK5调节亚基蛋白3有关	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
DDX21	DKFZp686F21172 \|卦\| GURDB \| RH-II /顾\| RH-II /卦	死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽21	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
EWSR1	EWS	尤因肉瘤断点地区1	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
FDFT1	DGPT \| ERG9 \| SQS \|党卫军	farnesyl-diphosphate批1	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
PPAN	BXDC3 \| MGC14226 \| MGC45852 \|社保基金\| SSF1 \| SSF2	彼得·潘同族体(果蝇)	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
RNMTL1	FLJ10581 \| HC90	核糖核酸甲基转移酶1	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
RPL3	MGC104284 \| TARBP-B	核糖体蛋白L3	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
RUVBL1	ECP54 \| INO80H \| NMP238 \|庞丁\| Pontin52 \| RVB1 \| TIH1 \| TIP49 \| TIP49A	RuvB-like 1(大肠杆菌)	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
SF3A2	PRP11 \| PRPF11 \| SAP62 \| SF3a66	剪接因子3单元66 kda	亲和力Capture-MS	BioGRID	12234937
SF3A3	PRP9 \| PRPF9 \| SAP61 \| SF3a60	剪接因子3单元3,60 kda	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
SF3B1	PRP10 \| PRPF10 \| SAP155 \| SF3b155	剪接因子3 b亚基1,155 kda	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
SF3B2	SAP145 \| SF3B145 \| SF3b1 \| SF3b150	剪接因子3 b亚基145 kda	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
SF3B3	KIAA0017 \| RSE1 \| SAP130 \| SF3b130 \| STAF130	剪接因子3 b亚基130 kda	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
SF3B4	MGC10828 \| SAP49 \| SF3b49	剪接因子3 b亚基4,49 kda	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931
SNRNP200	ASCC3L1 \| BRR2 \| HELIC2 \| u5 - 200 kd	小核200 kda核糖核蛋白(U5)	- - - - - -	HPRD, BioGRID	11331595
TSR1	FLJ10534 \| KIAA1401 \| MGC131829	TSR1 20 s rRNA积累,同族体(酵母)	亲和力Capture-MS	BioGRID	17353931

部分诉通路注释

路径名称	通道尺寸	# SZGR 2.0基因通路	信息
KEGG剪接体	128年	72年	所有SZGR 2.0基因通路
PRAMOONJAGO SOX4目标了	52	38	所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病	1382年	904年	所有SZGR 2.0基因通路
BORCZUK恶性间皮瘤起来	305年	185年	所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应表皮DN	508年	354年	所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应	712年	443年	所有SZGR 2.0基因通路
INAMURA肺癌鳞状细胞癌亚型	14	9	所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652年	1023年	所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络	1442年	892年	所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA CHEK2 PCC网络	779年	480年	所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN NIPP1的目标了	769年	437年	所有SZGR 2.0基因通路
魏MYCN目标与E箱	795年	478年	所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式	882年	572年	所有SZGR 2.0基因通路
DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡	314年	201年	所有SZGR 2.0基因通路
DE YY1 DN的目标	92年	64年	所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝癌了	973年	570年	所有SZGR 2.0基因通路
张乳腺癌的祖细胞	425年	253年	所有SZGR 2.0基因通路
穆勒PLURINET	299年	189年	所有SZGR 2.0基因通路
SHEDDEN肺癌生存A6差	456年	285年	所有SZGR 2.0基因通路
酒井法子慢性肝炎和肝癌	83年	63年	所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标	1972年	1213年	所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标3 DN	918年	550年	所有SZGR 2.0基因通路

基因页面:SMNDC1