概括
基因 1029
象征 CDKN2A
同义词 arf | cdk4i | cdkn2 | cmm2 | ink4 | ink4a | mlm | mts-1 | mts1 | mts1 | p14 | p14arf | p16 | p16-ink4a | p16ink4 | p16ink4 | p16ink4a | p19 | p19 | p19arf | p19arf | tp16 | tp16
描述 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2a
参考 MIM:600160|HGNC:HGNC:1787|ENSEMBL:ENSG00000147889|HPRD:02542|Vega:Otthumg0000000019686
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p21
Pascal P值 0.032
胎儿β -0.468
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0889

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00718440 9 21995312 CDKN2A -0.026 0.35 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 CDKN2A 1029 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 11278317|12740913|15989956
|17274640|17909018
去:0004861 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶抑制剂活性 艾达 8259215
GO:0051059 NF-kappab结合 艾达 10353611
GO:0019901 蛋白激酶结合 IPI 8259215
GO:0055105 泛素 - 蛋白连接酶抑制剂活性 ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000075 细胞周期检查点 小鬼 16243918
去:0000082 G1/s有丝分裂细胞周期的过渡 艾达 10208428
去:0001953 细胞矩阵粘附的阴性调节 小鬼 10205165
去:0006309 凋亡期间的DNA碎片 小鬼 12082630
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
去:0006469 蛋白激酶活性的负调控 小鬼 15582998
去:0006364 rRNA处理 IEA -
去:0006917 诱导凋亡 艾达 10208428
去:0006917 诱导凋亡 小鬼 12082630
去:0007050 细胞周期停滞 小鬼 15582998|16243918
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 小鬼 16243918
去:0008637 凋亡线粒体变化 小鬼 12082630
GO:0010149 衰老 小鬼 14720514|14966292
GO:0048103 体干细胞分裂 ISS -
GO:0010389 G2/M的调节有丝分裂细胞周期的过渡 小鬼 15582998
去:0006919 caspase激活 小鬼 12082630
去:0006915 凋亡 IEA -
GO:0042326 磷酸化的负调节 艾达 8259215|10208428
去:0033088 胸腺中未成熟T细胞增殖的负调节 ISS -
GO:0032088 NF-kappab转录因子活性的负调节 艾达 10353611
去:0030308 细胞生长的负调控 艾达 10208428
GO:0031647 蛋白质稳定性调节 ISS -
GO:0030889 B细胞增殖的阴性调节 ISS -
GO:0045736 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性的阴性调节 艾达 8259215
GO:0045786 细胞周期的负调控 IEA -
GO:0051444 泛素 - 蛋白连接酶活性的阴性调节 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 16243918
去:0005634 IEA -
去:0005654 核质 艾达 17110379
去:0005730 核仁 艾达 17110379
去:0005737 细胞质 艾达 16243918

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ALS2CR8 卡夫|DKFZP667N246 |FLJ12675 |FLJ21579 |NYD-SP24 肌萎缩性外侧硬化症2(少年)染色体区域,候选8 - HPRD 12154087
奥卡 aik |ark1 |光环|Aurora2 |btak |MGC34538 |STK15 |stk6 |STK7 Aurora激酶A。 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
CCND1 bcl1 |D11S287E |prad1 |U21B31 Cyclin D1 重构的复合物 Biogrid 10580009
CCND2 Kiak0002 |MGC102758 细胞周期蛋白D2 重构的复合物 Biogrid 15065884
CCNG1 CCNG 细胞周期蛋白G1 - HPRD,Biogrid 12556559
CDK4 CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 P16与CDK4相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类p16和CDK4之间的相互作用进行建模的。 绑定 9482104
CDK4 CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 CDKN2A与CDK4相互作用 绑定 11556834
CDK4 CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 - HPRD,Biogrid 9228064
CDK4 CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 - HPRD 9228064|15232106
CDK4 CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 P16与CDK4相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类p16和CDK4之间的相互作用进行建模的。 绑定 10491434
CDK4 CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 P16与CDK4相互作用。 绑定 8805225
CDK6 MGC59692 |plstire |STQTL11 细胞周期蛋白依赖性激酶6 CDKN2A与CDK6相互作用 绑定 11556834
CDK6 MGC59692 |plstire |STQTL11 细胞周期蛋白依赖性激酶6 P16与CDK6相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类p16和CDK6之间的相互作用进行建模的。 绑定 10491434
CDK6 MGC59692 |plstire |STQTL11 细胞周期蛋白依赖性激酶6 P16与CDK6相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类p16和CDK6之间的相互作用进行建模的。 绑定 9482104
CDK6 MGC59692 |plstire |STQTL11 细胞周期蛋白依赖性激酶6 P16与CDK6相互作用。 绑定 8805225
CDK6 MGC59692 |plstire |STQTL11 细胞周期蛋白依赖性激酶6 - HPRD,Biogrid 9751050
CDKN2AIP 卡夫|FLJ20036 CDKN2A相互作用的蛋白质 - HPRD 12154087
CDKN2C ink4c |P18 |p18-ink4c 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2C(P18,抑制CDK4) - HPRD 8259215
E2F1 E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 E2F转录因子1 P14arf与E2F-1相互作用。 绑定 12082609
E4F1 e4f |MGC99614 E4F转录因子1 - HPRD,Biogrid 12446718
FKBP2 FKBP-13 |PPIASE FK506结合蛋白2,13KDA 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12606707
hif1a HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 低氧诱导因子1,α亚基(基本螺旋 - 环螺旋转录因子) P14arf与HIF-1Alpha相互作用。 绑定 11382768
Huwe1 ARF-BP1 |hecth9 |HSPC272 |IB772 |KIAA0312 |lasu1 |m子|UREB1 Hect,UBA和WWE域,包含1个 ARF与ARF-BP1相互作用。 绑定 15989956
MAPK10 FLJ12099 |FLJ33785 |JNK3 |jnk3a |MGC50974 |prkm10 |P493F12 |P54BSAPK 有丝分裂原激活的蛋白激酶10 CDKN2A(P16INK4A)与MAPK10相互作用(JNK3) 绑定 16007099
MAPK8 jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 CDKN2A(P16INK4A)与MAPK8(JNK1)相互作用 绑定 16007099
MCM2 BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 微型鲜体维护复杂组件2 - HPRD 15232106
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) - HPRD 9529248|12085228 | 9529249
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) P14ARF与MDM2的未指定同工型相互作用。 绑定 12582152
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) 亲和力捕获ms
亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9529248|9529249
|12085228|14612427
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) MDM2与p14arf相互作用。 绑定 10822382
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) P14与MDM2相互作用。 绑定 15355988
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) MDM2与P14ARF相互作用 绑定 9653180
MDM4 DKFZP781B1423 |HDMX |MDMX |MGC132766 |MRP1 MDM4 p53结合蛋白同源物(小鼠) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11297540
我的C Bhlhe39 |c-myc V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物(禽类) P14ARF与C-MYC相互作用。 绑定 15361884
NCOR1 KIAA1047 |MGC104216 |n-cor |trac1 |HCIT529I10 |hn-cor 核受体共抑制剂1 NCOR1(N-COR)与P-P14(ARF)(P14(ARF)启动子)相互作用。 绑定 15729358
NCOR2 CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 核受体共抑制剂2 NCOR2(SMRT)与P-P14(ARF)(P14(ARF)启动子)相互作用。 绑定 15729358
Plekha8 fapp2 |MGC3358 含有含有家族的pleckstrin同源域(磷酸肌醇结合特异性)成员8 重构的复合物 Biogrid 15107860
PPP1R9B FLJ30345 |PPP1R6 |PPP1R9 |Spino |SPN 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基9B - HPRD,Biogrid 11278317
PPP1R9B FLJ30345 |PPP1R6 |PPP1R9 |Spino |SPN 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基9B Spino与P14arf相互作用。 绑定 11278317
PSMC3 MGC8487 |TBP1 蛋白酶体(Prosome,大蛋白)26S亚基,ATPase,3 P14arf与TBP-1相互作用。 绑定 14665636
RPL11 Gig34 核糖体蛋白L11 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14612427
Sertad1 sei1 |Trip-BR1 包含1的serta域 - HPRD,Biogrid 10580009|15065884
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9529249|12446718
|14612427
ube2a HHR6A |rad6a |UBC2 泛素结合酶E2A(RAD6同源物) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12640129
WRN DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 Werner综合征 P14与WRN相互作用。 绑定 15355988
yy1 delta |INO80S |NF-E1 |UCRBP |阴阳1 YY1转录因子 YY1与p14arf相互作用。 绑定 15210108
ZNF410 APA-1 |APA1 锌指蛋白410 - HPRD 12370286


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg细胞周期 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG P53信号通路 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg神经胶质瘤 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg黑色素瘤 71 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg膀胱癌 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG慢性髓细胞性白血病 73 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG非小细胞肺癌 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta G1途径 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CTCF途径 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔细胞途径 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ARF途径 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG PIP3在心脏肌周期中发出信号 67 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST整合素信号通路 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA G1和S阶段 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
心肌细胞中的SIG胰岛素受体途径 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA Reg Cyclin Expr的级联 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST磷酸肌醇3激酶途径 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID E2F途径 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR途径 61 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FRA路径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC PATHWAY 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1途径 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXM1途径 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1A途径 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta Catenin nuc途径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Delta NP63途径 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TAP63途径 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53调节途径 59 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RB 1 Pathway 65 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G1相 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有丝分裂G1 G1 S相 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON HPV阳性肿瘤 98 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤DN 104 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Slebos头和颈癌与HPV 84 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Castellano NRAS靶向DN 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗PML目标由MYC DN绑定 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
高田胃癌拷贝编号DN 29 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUSA SAM68靶向 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roversi Glioma副本编号DN 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯蒂宫颈癌增殖簇 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dawson TCL1中的甲基化 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成人癌中甲基化的欧姆 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
欧姆胚胎癌DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼永生dn 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌B 48 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TCGA胶质母细胞瘤副本编号DN 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
丁肺癌显着突变 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL治愈与致命DN 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tenedini Megakaryocyte标记 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木对TSA和Decitabine 1A的反应 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sato在胰腺癌中表观遗传沉默 49 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C3的反应 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌中甲基化的甲基化 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌DN中甲基化的甲基化 28 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤副本编号DN 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的甲基化 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bohn原发性免疫缺陷综合症DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen部分重编程为多能 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li前列腺癌表观遗传 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 193 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 180 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因