基因页面:RTN3
总结吗?
GeneID | 10313年 |
象征 | RTN3 |
同义词 | ASYIP | HAP | NSPL2 | NSPLII | RTN3-A1 |
描述 | reticulon 3 |
参考 | MIM: 604249|HGNC: HGNC: 10469|运用:ENSG00000133318|HPRD: 18516|织女:OTTHUMG00000168056 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 11个问题 |
帕斯卡假定值 | 0.039 |
夏洛克假定值 | 0.393 |
支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RTN3_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PLK1 | 0.99 | 0.83 |
AURKB | 0.99 | 0.66 |
KIF2C | 0.99 | 0.72 |
KIFC1 | 0.99 | 0.74 |
UBE2C | 0.99 | 0.67 |
MYBL2 | 0.98 | 0.70 |
CDC20 | 0.98 | 0.68 |
GTSE1 | 0.98 | 0.75 |
FAM64A | 0.98 | 0.67 |
NCAPH | 0.98 | 0.73 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.38 | -0.59 |
AF347015.27 | -0.37 | -0.71 |
HLA-F | -0.37 | -0.50 |
FBXO2 | -0.36 | -0.46 |
AF347015.31 | -0.36 | -0.71 |
PTH1R | -0.36 | -0.44 |
AF347015.33 | -0.35 | -0.66 |
ABCG2 | -0.35 | -0.48 |
MT-CO2 | -0.35 | -0.69 |
MT-CYB | -0.35 | -0.69 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
COL4A3BP | CERT | CERTL | FLJ20597 | GPBP | STARD11 | IV型胶原蛋白,α3 (Goodpasture抗原)结合蛋白 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
FAM160A2 | C11orf56 | DKFZp566M1046 | FLJ22665 | KIAA1759 | 家庭160序列相似性,成员A2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
FGFR1 | BFGFR | CD331 | CEK | FGFBR FLG | | FLJ99988 | FLT2 | HBGFR | KAL2 | N-SAM | 纤维母细胞生长因子受体1 | FGFR1与RTN3交互的一个未指明的同种型。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类RTN3 FGFR1。 | 绑定 | 15117958 |
FXR2 | FMR1L2 | 脆性X智力迟钝,常染色体同族体2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
PLEKHF2 | FLJ13187 | PHAFIN2 | ZFYVE18 | 与FYVE pleckstrin同源域包含家庭F(域)成员2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
PTPN9 | MEG2 | PTPMEG2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,non-receptor类型9 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
RAB33A | MGC1488 | RabS10 | RAB33A, RAS致癌基因家族成员 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
RTN3 | ASYIP | HAP | NSPL2 | NSPLII | RTN3-A1 | reticulon 3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
RTN4 | 容易| NI220/250 |勿动蛋白| NOGO-A | NOGOC NSP | | NSP-CL | Nbla00271 | Nbla10545 | Nogo-B | Nogo-C | RTN-X | RTN4-A | RTN4-B1 | RTN4-B2 | RTN4-C | reticulon 4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
SPOP | TEF2 | speckle-type POZ蛋白质 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
UGCG | GCS | UDP-glucose神经酰胺葡糖基转移酶 | 2台混合动力 | BioGRID | 12873973 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
大黄酸糖皮质激素治疗DN | 362年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HAHTOLA蕈样皮肤 | 177年 | 113年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群3 | 329年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANHARANTA子宫肌瘤DN | 67年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群2 b | 392年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ALCALA细胞凋亡 | 88年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
科林PILOCYTIC星形细胞瘤和胶质母细胞瘤 | 35 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹多发性骨髓瘤两张cd VS | 66年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
具备干细胞RAMALHO DN | 74年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伯顿脂肪生成6 | 189年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PASINI SUZ12目标 | 315年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |