概括
基因 10317
象征 B3GALT5
同义词 B3GALT-V | B3GALTX | B3T5 | GLCT5 | beta-1,3-Galtase 5 | beta-3-GX-T5 | beta3gal-t5
描述 β-1,3-半乳糖基转移酶5
参考 MIM:604066|HGNC:HGNC:920|ENSEMBL:ENSG00000183778|HPRD:06818|Vega:Otthumg00000086725
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.3
Pascal P值 0.425
胎儿β 0.06

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SDCCAG10 0.94 0.90
ZCCHC7 0.93 0.93
RSL1D1 0.93 0.93
RBM39 0.92 0.91
TDRD3 0.91 0.92
DDX59 0.91 0.82
SKIV2L2 0.91 0.89
VRK1 0.91 0.89
CBX3 0.91 0.93
NPM1 0.90 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.59 -0.79
AF347015.27 -0.57 -0.82
AF347015.31 -0.57 -0.83
SLC9A3R2 -0.57 -0.61
MT-CO2 -0.57 -0.84
FBXO2 -0.56 -0.70
AF347015.33 -0.56 -0.82
tinagl1 -0.56 -0.76
mt-cyb -0.56 -0.83
AIFM3 -0.56 -0.75

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg糖果果脂生物合成球序列 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时 55 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因