基因页:B3GALT5
概括?
基因 | 10317 |
象征 | B3GALT5 |
同义词 | B3GALT-V | B3GALTX | B3T5 | GLCT5 | beta-1,3-Galtase 5 | beta-3-GX-T5 | beta3gal-t5 |
描述 | β-1,3-半乳糖基转移酶5 |
参考 | MIM:604066|HGNC:HGNC:920|ENSEMBL:ENSG00000183778|HPRD:06818|Vega:Otthumg00000086725 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q22.3 |
Pascal P值 | 0.425 |
胎儿β | 0.06 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/B3GALT5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SDCCAG10 | 0.94 | 0.90 |
ZCCHC7 | 0.93 | 0.93 |
RSL1D1 | 0.93 | 0.93 |
RBM39 | 0.92 | 0.91 |
TDRD3 | 0.91 | 0.92 |
DDX59 | 0.91 | 0.82 |
SKIV2L2 | 0.91 | 0.89 |
VRK1 | 0.91 | 0.89 |
CBX3 | 0.91 | 0.93 |
NPM1 | 0.90 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.59 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.82 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.83 |
SLC9A3R2 | -0.57 | -0.61 |
MT-CO2 | -0.57 | -0.84 |
FBXO2 | -0.56 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.82 |
tinagl1 | -0.56 | -0.76 |
mt-cyb | -0.56 | -0.83 |
AIFM3 | -0.56 | -0.75 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg糖果果脂生物合成球序列 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时 | 55 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |