基因页：LAMC3
概括？
| 基因 | 10319 |
| 象征 | LAMC3 |
| 同义词 | OCCM |
| 描述 | 层粘连蛋白亚基3 |
| 参考 | MIM：604349|HGNC：HGNC：6494|Ensembl：ENSG00000050555|HPRD：05069|Vega：Otthumg00000020819 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9Q34.12 |
| Pascal P值 | 0.004 |
| Sherlock P值 | 0.394 |
| 胎儿β | -0.417 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14447608 | 9 | 133886309 | LAMC3 | 4.932E-4 | 0.366 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| IPO7 | 0.94 | 0.95 |
| NCOA4 | 0.92 | 0.94 |
| CAND1 | 0.92 | 0.94 |
| C7orf60 | 0.92 | 0.92 |
| ABCE1 | 0.92 | 0.93 |
| IPO5 | 0.92 | 0.92 |
| KPNA5 | 0.91 | 0.93 |
| Cul4b | 0.91 | 0.93 |
| PPAT | 0.91 | 0.91 |
| DNAJC18 | 0.91 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.80 |
| AF347015.31 | -0.68 | -0.78 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.75 |
| ifi27 | -0.65 | -0.76 |
| FXYD1 | -0.65 | -0.76 |
| AF347015.21 | -0.65 | -0.77 |
| higd1b | -0.65 | -0.75 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID A6B1 A6B4整合素途径 | 46 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA地下室膜 | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |