基因页:CDKN3
概括?
基因 | 1033 |
象征 | CDKN3 |
同义词 | cdi1 | cip2 | kap | kap1 |
描述 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂3 |
参考 | MIM:123832|HGNC:HGNC:1791|Ensembl:ENSG00000100526|HPRD:00450|Vega:Otthumg00000140302 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q22 |
Pascal P值 | 0.207 |
Sherlock P值 | 0.185 |
胎儿β | 1.082 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Kranz_2015 | 整个外显子组测序和靶向测序 | 通过WES鉴定了5个基因中的DNM,并在本研究中通过TS独立验证 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CDKN3 | CHR14 | 54878244 | G | 一个 | NM_001130851 | p.c39y | 非单词snv | 2.677 | d | 精神分裂症 | DNM:Kranz_2015 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS889558 | CHR16 | 57172628 | CDKN3 | 1033 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CDKN3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf30 | 0.79 | 0.80 |
mpp2 | 0.78 | 0.79 |
rundc1 | 0.78 | 0.85 |
GRB10 | 0.77 | 0.82 |
ATG16L1 | 0.77 | 0.83 |
EIF2AK4 | 0.76 | 0.85 |
ARMC9 | 0.76 | 0.80 |
CD200 | 0.76 | 0.78 |
PGRMC1 | 0.75 | 0.72 |
tnfaip1 | 0.75 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.66 |
MT-CO2 | -0.61 | -0.65 |
AF347015.8 | -0.60 | -0.64 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.58 |
mt-cyb | -0.58 | -0.61 |
AF347015.15 | -0.57 | -0.60 |
AF347015.33 | -0.57 | -0.59 |
higd1b | -0.57 | -0.60 |
AF347015.27 | -0.56 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发后期DN | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sotiriou乳腺癌1级vs 3 | 151 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2的反应 | 146 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pramoonjago Sox4靶向DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向DN | 139 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与正常静止 | 87 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham正常静止与正常分裂DN | 87 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
受甲基化DN调节的Missiaglia | 122 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数量大与微小 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 | 167 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和TP73 DN的SCIAN细胞周期目标 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath增殖 | 147 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori大型BII淋巴细胞向上 | 86 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori未成熟B淋巴细胞DN | 90 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞DN | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peart HDAC增殖集群 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤 | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yu Myc的目标 | 42 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴vs血液 | 131 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V2晚分化基因 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德斯癌元签名 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU HBX目标3 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KANG阿霉素耐药性 | 54 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rhodes未分化的癌症 | 69 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU HBX目标1向上 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang被甲基化DN沉默 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YIH对砷C3的反应 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C7的反应 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU HBX目标2向上 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时DN | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
库曼托对Nutlin 3A DN的响应 | 10 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN | 50 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee早期T淋巴细胞向上 | 107 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist IL6剥夺DN | 98 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRAS信号传导DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRA与基质刺激DN | 99 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi EGFR信令24小时DN | 251 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
winnepenninckx黑色素瘤转移 | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP | 87 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期文献 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dormoy Elavl1目标 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
24小时IR响应中的周细胞周期基因 | 128 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |