概括
基因 1033
象征 CDKN3
同义词 cdi1 | cip2 | kap | kap1
描述 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂3
参考 MIM:123832|HGNC:HGNC:1791|Ensembl:ENSG00000100526|HPRD:00450|Vega:Otthumg00000140302
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q22
Pascal P值 0.207
Sherlock P值 0.185
胎儿β 1.082
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Kranz_2015 整个外显子组测序和靶向测序 通过WES鉴定了5个基因中的DNM,并在本研究中通过TS独立验证
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
CDKN3 CHR14 54878244 G 一个 NM_001130851 p.c39y 非单词snv 2.677 d 精神分裂症 DNM:Kranz_2015

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS889558 CHR16 57172628 CDKN3 1033 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf30 0.79 0.80
mpp2 0.78 0.79
rundc1 0.78 0.85
GRB10 0.77 0.82
ATG16L1 0.77 0.83
EIF2AK4 0.76 0.85
ARMC9 0.76 0.80
CD200 0.76 0.78
PGRMC1 0.75 0.72
tnfaip1 0.75 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.63 -0.68
AF347015.31 -0.63 -0.66
MT-CO2 -0.61 -0.65
AF347015.8 -0.60 -0.64
AF347015.2 -0.58 -0.58
mt-cyb -0.58 -0.61
AF347015.15 -0.57 -0.60
AF347015.33 -0.57 -0.59
higd1b -0.57 -0.60
AF347015.27 -0.56 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发后期DN 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sotiriou乳腺癌1级vs 3 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2的反应 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pramoonjago Sox4靶向DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常静止 87 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML分割与正常静止 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham正常静止与正常分裂DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
受甲基化DN调节的Missiaglia 122 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数量大与微小 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和TP73 DN的SCIAN细胞周期目标 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath增殖 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori大型BII淋巴细胞向上 86 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori未成熟B淋巴细胞DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞DN 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peart HDAC增殖集群 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯肝癌 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc的目标 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴vs血液 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V2晚分化基因 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su睾丸 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标3 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG阿霉素耐药性 54 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rhodes未分化的癌症 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标1向上 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang被甲基化DN沉默 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C3的反应 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C7的反应 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标2向上 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时DN 101 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
库曼托对Nutlin 3A DN的响应 10 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞向上 107 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist IL6剥夺DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS信号传导DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRA与基质刺激DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP 87 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期文献 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dormoy Elavl1目标 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
24小时IR响应中的周细胞周期基因 128 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因