概括
基因 10345
象征 trdn
同义词 cpvt5 | tdn | trisk
描述 三合会
参考 MIM:603283|HGNC:HGNC:12261|ENSEMBL:ENSG00000186439|HPRD:04474|Vega:Otthumg0000000015497
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q22.31
Pascal P值 0.007
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17027208 CHR3 31219519 trdn 10345 0.05 反式
RS10994209 Chr10 61877705 trdn 10345 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
hnrnpu 0.97 0.97
top1 0.96 0.96
SMC3 0.96 0.96
SUPT16H 0.96 0.96
tardbp 0.95 0.96
MSH6 0.95 0.94
PRPF40A 0.95 0.94
Stag1 0.95 0.96
RSF1 0.95 0.94
myef2 0.95 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.71 -0.88
AF347015.31 -0.71 -0.87
ifi27 -0.71 -0.87
HLA-F -0.70 -0.79
MT-CO2 -0.70 -0.88
C5orf53 -0.69 -0.74
AF347015.27 -0.69 -0.84
AF347015.33 -0.69 -0.84
TSC22D4 -0.68 -0.80
higd1b -0.67 -0.86

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005102 受体结合 IEA 神经递质(GO期限:4) -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006936 肌肉收缩 塔斯 7588753
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 艾达 11026130
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 塔斯 7588753
去:0005886 质膜 艾达 11026130
去:0033017 肌质网膜 IEA -
GO:0016529 肌质网 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因