基因页:trdn
概括?
基因 | 10345 |
象征 | trdn |
同义词 | cpvt5 | tdn | trisk |
描述 | 三合会 |
参考 | MIM:603283|HGNC:HGNC:12261|ENSEMBL:ENSG00000186439|HPRD:04474|Vega:Otthumg0000000015497 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q22.31 |
Pascal P值 | 0.007 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17027208 | CHR3 | 31219519 | trdn | 10345 | 0.05 | 反式 | ||
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | trdn | 10345 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRDN_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hnrnpu | 0.97 | 0.97 |
top1 | 0.96 | 0.96 |
SMC3 | 0.96 | 0.96 |
SUPT16H | 0.96 | 0.96 |
tardbp | 0.95 | 0.96 |
MSH6 | 0.95 | 0.94 |
PRPF40A | 0.95 | 0.94 |
Stag1 | 0.95 | 0.96 |
RSF1 | 0.95 | 0.94 |
myef2 | 0.95 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.71 | -0.88 |
AF347015.31 | -0.71 | -0.87 |
ifi27 | -0.71 | -0.87 |
HLA-F | -0.70 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.88 |
C5orf53 | -0.69 | -0.74 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.84 |
TSC22D4 | -0.68 | -0.80 |
higd1b | -0.67 | -0.86 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | IEA | 神经递质(GO期限:4) | - |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006936 | 肌肉收缩 | 塔斯 | 7588753 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11026130 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | 塔斯 | 7588753 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 11026130 | |
去:0033017 | 肌质网膜 | IEA | - | |
GO:0016529 | 肌质网 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani病毒GPCR信号向上 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |