概括
基因 10361
象征 NPM2
同义词 -
描述 核素/核纤维素2
参考 MIM:608073|HGNC:HGNC:7930|ENSEMBL:ENSG00000158806|HPRD:12160|Vega:Otthumg00000131129
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p21.3
Pascal P值 0.76
Sherlock P值 0.882
胎儿β -0.836
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03998605 8 21882061 NPM2 2.04e-9 -0.021 1.65E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1949359 Chr10 64356992 NPM2 10361 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003676 核酸结合 IEA -
GO:0042393 组蛋白结合 塔斯 12581654
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006338 染色质重塑 艾达 12714744
去:0007338 单肥 小鬼 12714744
去:0007096 调节有丝分裂的退出 小鬼 12714744
去:0009790 胚胎发展 小鬼 12714744
去:0009994 卵母细胞分化 IEP 12714744
GO:0045836 减数分裂的阳性调节 小鬼 12714744
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000789 细胞质染色质 艾达 12714744
去:0000790 核染色质 艾达 12714744
去:0005634 艾达 12714744
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的加沙表观遗传沉默 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk孕产妇效应 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因