基因页:CDR1
概括?
基因 | 1038 |
象征 | CDR1 |
同义词 | CDR | CDR34 | CDR62A |
描述 | 小脑变性相关蛋白1 |
参考 | MIM:302650|HGNC:HGNC:1798|HPRD:02361| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ27.1 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.396 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | CDR1 | 1038 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CDR1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Mycn扩增靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标2小时 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |