基因页：BPNT1
概括？
| 基因 | 10380 |
| 象征 | BPNT1 |
| 同义词 | HEL20 | PIP |
| 描述 | 3'（2'），5'-双磷酸核苷酸酶1 |
| 参考 | MIM：604053|HGNC：HGNC：1096|ENSEMBL：ENSG00000162813|HPRD：06814|Vega：Otthumg0000000037435 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q41 |
| 胎儿β | 0.241 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07017209 | 1 | 220263177 | BPNT1 | 1.065E-4 | -0.323 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
| CG06807791 | 1 | 220232018 | BPNT1 | 3.268E-4 | 0.219 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CAND1 | 0.97 | 0.98 |
| ube3a | 0.96 | 0.97 |
| Exoc5 | 0.96 | 0.97 |
| SMEK2 | 0.96 | 0.96 |
| Cul4b | 0.96 | 0.97 |
| ABCE1 | 0.96 | 0.96 |
| CSNK1G3 | 0.96 | 0.97 |
| FYTTD1 | 0.96 | 0.96 |
| KPNA4 | 0.96 | 0.96 |
| nudt21 | 0.96 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.74 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.83 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.82 |
| ifi27 | -0.71 | -0.82 |
| AC018755.7 | -0.71 | -0.75 |
| higd1b | -0.70 | -0.82 |
| AF347015.33 | -0.70 | -0.79 |
| HSD17B14 | -0.70 | -0.77 |
| mt-cyb | -0.69 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.69 | -0.81 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
| 去：0004437 | 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008441 | 3'（2'），5'-双磷酸核苷酸酶活性 | 经验 | 10224133 | |
| 去：0008441 | 3'（2'），5'-双磷酸核苷酸酶活性 | 塔斯 | 10224133 | |
| GO：0031403 | 锂离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 10224133 |
| 去：0006139 | 核苷酶，核苷，核苷酸和核酸代谢过程 | 塔斯 | 10224133 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 10224133 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg硫代谢 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SA PTEN途径 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组胞质硫化 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈肝新陈代谢QTL顺式 | 93 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 628 | 634 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
| mir-409-3p | 627 | 633 | M8 | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |