概括
基因 10400
象征
同义词 peamt | pempt | pemt2 | pnmt
描述 磷脂酰乙醇胺N-甲基转移酶
参考 MIM:602391|HGNC:HGNC:8830|Ensembl:ENSG00000133027|HPRD:03862|Vega:Otthumg0000000059290
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p11.2
Pascal P值 0.089
Sherlock P值 0.458
胎儿β -0.154
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15627593 17 17457836 2.26e-5 0.611 0.017 DMG:Wockner_2014
CG26403559 17 17494874 2.93E-5 -0.317 0.018 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004608 磷脂酰乙醇胺N-甲基转移酶活性 塔斯 9989271
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008170 N-甲基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008654 磷脂生物合成过程 IEA -
去:0008283 细胞增殖 塔斯 9989271
去:0006656 磷脂酰胆碱生物合成过程 塔斯 9989271
去:0006644 磷脂代谢过程 IEA -
去:0006629 脂质代谢过程 塔斯 9989271
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0031966 线粒体膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome合成 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类polymomy7 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌晚期复发DN 69 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Woo肝癌复发DN 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对Troglitazone DN的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因